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confirmée par des études expérimentales directes, la modélisation précise des déplacements du vecteur perdra une partie de ses justifications. En effet, cette étape resterait utile dans la perspective lointaine de l’utilisation de pièges attractifs, mais l’objectif immédiat d’optimiser la lutte locale basée sur l’arrachage deviendrait caduc. La suite logique de ce travail est donc de quantifier directement les capacités de transmission des différents stades du vecteur selon la date de l’acquisition, le préalable étant de disposer d’une méthode d’élevage efficace et comparable avec les conditions naturelles. Les comportements du vecteur (attraction par les plantes malades, par les autres vecteurs, fréquence des déplacements) méritent également d’être étudiés avec attention, que ce soit expérimentalement ou par des tests d’hypothèses sur d’autres vergers. Enfin, dans une optique plus finalisée, la modélisation prédictive des dates de présence du vecteur et de son abondance dans les vergers en fonction de paramètres climatiques peut permettre d’optimiser les traitements insecticides ; cependant, dans un premier temps, une approche plus empirique (impliquant par exemple des captures de C. pruni sur les prunelliers) peut jouer ce rôle. Le deuxième axe à développer pour mieux comprendre la dynamique épidémique concerne la période infectieuse des arbres (en particulier les liens entre durée de latence et durée d’incubation) en fonction du climat et de leur âge lors de l’inoculation par les vecteurs. En effet, la méconnaissance de ce paramètre démultiplie les interprétations possibles des motifs spatio-temporels observés. De plus, ce phénomène introduit dans le système une inertie à prendre en compte en théorie comme en pratique. Son évaluation directe pose de sérieux problèmes expérimentaux faute de méthode fiable pour obtenir de grandes quantités d’insectes infectieux mais elle mérite d’être entreprise au vu des enjeux. L’analyse de suivis temporels dans des vergers issus de semis pourrait être un moyen indirect et complémentaire d’estimer la durée d’incubation des jeunes arbres. Enfin, un troisième aspect fondamental pour comprendre le fonctionnement du système a été très peu abordé au cours de ce mémoire : il s’agit d’estimer précisément la contribution relative des Prunus sauvages et domestiques à la dynamique épidémique. Si l’impact potentiel des plantes sauvages infectieuses sur la gestion de la maladie a déjà été précisé au début de cette conclusion, le thème des échanges entre les plantes sauvages et domestiques ouvre également des perspectives intéressantes sur un plan plus théorique. En effet, l’étude d’une éventuelle spécialisation des populations de C. pruni en fonction de la plante hôte et l’examen des migrations du vecteur entre Prunus et conifères pourraient révéler des facettes inattendues de l’épidémiologie de l’ESFY et témoigner des liens entre la génétique des populations et l’épidémiologie. Les informations nouvelles ainsi obtenues pourraient être intégrées dans un modèle dépassant l’échelle spatiale et temporelle du verger, destiné par exemple à analyser les rétroactions potentielles sur le système épidémique en cas d’introduction massive d’une espèce très sensible ou très résistante. Sur le plan méthodologique, l’expérience acquise a permis de s’apercevoir que l’absence de tests d’hypothèses génériques basés sur les motifs spatio-temporels dessinés par les plantes malades peut ralentir la phase exploratoire des recherches sur l’épidémiologie d’une maladie. Certains des articles présentés dans ce mémoire ont donc visé à combler partiellement cette lacune en proposant des tests pour des hypothèses relativement classiques. Il apparaît clairement que la préexistence d’un ensemble de tests regroupés dans un cadre flexible permettrait d’accélérer les analyses, améliorant ainsi la réactivité face à une émergence. En ce qui concerne l’organisation de cette phase exploratoire initiale, il semble d’ailleurs que l’une des premières démarches à entreprendre suite à une émergence soit de mettre en place un essai multilocal dans une zone contaminée, avec des parcelles de taille suffisante constituées de plantes présentant toutes les garanties sanitaires et dont un lot témoin serait conservé dans un local protégé pendant la durée de l’essai. La répartition spatio-temporelle des plantes - 132 -
malades correspondrait alors uniquement à la propagation naturelle de la maladie : une partie des motifs observés (et des hypothèses explicatives) serait ainsi avantageusement éliminée. Une autre voie qui pourrait nécessiter le développement ou la transposition de méthodes spécifiques concerne l’estimation des paramètres d’un modèle à partir de l’observation des positions des plantes malades. Ces différentes pistes de recherche s’inscrivent dans la démarche proposée et illustrée au cours de ce mémoire, car elles s’appuient sur la complémentarité entre expérimentation et modélisation afin de répondre à des questions épidémiologiques, tout en impliquant d’autres disciplines. II. Conclusions sur la démarche retenue Pour conclure, on peut insister sur la stratégie de recherche qui a été choisie, car elle constitue l’apport le plus générique de ce travail centré sur un pathosystème spécifique. L’idée directrice est simple : l’efficacité de l’exploration initiale d’un système épidémique mal connu repose sur la combinaison d’approches et de disciplines différentes. Ainsi, le Tableau 8 résume les facteurs analysés par les différentes approches retenues. Tableau 8. Apports des différentes approches dans l’analyse des facteurs impliqués dans le développement spatio-temporel de l’ESFY. Expéri- Enquête Bibliographie mentation régionale • cycle du • âge du verger • identité du vecteur vecteur • multiplication puis rétention • plantes hôtes du pathogène principales • potentiel du pathogène infectieux du et du vecteur vecteur selon son âge • une partie des modalités de • proportion la vection d’insectes infectieux • génétique du greffon • génétique du porte-greffe • structure du parcellaire • pratiques de l’arboriculteur • origine du matériel • agrégation des transmissions a Apports attendus dans de futurs travaux. - 133 - Tests d’hypothèses Modèle mécaniste a • rôle des bords • isotropie des déplacements • influence des arbres avec des symptômes . • effet des variétés • nature des transmissions • nombre de vecteurs infectieux par an • distance et fréquence des déplacements des vecteurs • durée d’incubation Si l’on se réfère à la Figure 3 (p. 11) présentant un cadre d’étude pour les maladies mal connues, cinq des huit voies d’étude mentionnées ont été abordées. En effet, la stratégie choisie combine l’étude de l’association entre pratiques culturales et prévalence de la maladie, l’identification expérimentale de propriétés de la vection, des tests d’hypothèses sur la localisation spatio-temporelle des arbres malades et la modélisation des processus sousjacents ; notre approche implique également, mais de façon plus marginale, un investissement dans le diagnostic et des suggestions sur la gestion de la maladie. La gestion optimale d’une maladie prend en compte ses propriétés épidémiologiques plutôt que d’apporter une réponse stéréotypée et maximaliste. Dans cette optique, il est nécessaire de se baser sur une conjonction d’approches différentes, car chaque approche prise individuellement peut être trompeuse. L’ESFY en est un bon exemple, puisque la confrontation des différentes approches employées indique que la transmission se déroule
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Conifères ? Rétention du phytopla
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Identifying Risk Factors from a Sur
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Influence of the Risk Factors. The
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A toolbox for the specific detectio
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Bordeaux). Plant samples were also
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