(19) 대한민국특허청(KR) (12) 공개특허공보(A) - Questel

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항체 또는 이의 항원 결합 부분의 중쇄 및 경쇄 가변 영역에서 다른 아미노산 잔기보다 더욱 가변적인(즉, 초가
변적인) 아미노산 잔기의 번호 부여 시스템을 의미한다[참조: Kabat et al., (1971) Ann. NY Acad. Sci. 190:
382-391; Kabat et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S.
Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242]. 중쇄 가변 영역의 경우, 초가변
영역은 CDR1에서 아미노산 31-35번 위치, CDR2에서 아미노산 50-65번 위치 및 CDR3에서 아미노산 95-102번 위치
의 범위이다. 경쇄 가변 영역의 경우, 초가변 영역은 CDR1에서 아미노산 24-34번 위치, CDR2에서 아미노산 50-
56번 위치 및 CDR3에서 아미노산 89-97번 위치의 범위이다.
지난 20년 동안 가변 중쇄 및 경쇄 영역의 아미노산 서열에 대한 광범위한 공개용 데이터베이스의 성장 및 분석
으로, 가변 영역 서열 내의 골격 영역(FR)과 CDR 서열 사이의 전형적인 경계선이 이해되었고, 이로 인해 당업자
는 캐뱃 번호 부여, 쵸티아 번호 부여 또는 다른 시스템에 따라 CDR을 정확히 결정할 수 있게 되었다[참조:
Martin, In Kontermann and Dubel, eds., Antibody Engineering (Springer-Verlag, Berlin, 2001), chapter
31, pages 432-433]. 가변 중쇄 (VH) 및 경쇄 (VL) 영역의 아미노산 서열 내에서 캐뱃 CDR의 아미노산 서열을
결정하는 유용한 방법은 아래에 제시된다.
CDR-L1 아미노산 서열의 동정:
VL 영역의 아미노 말단으로부터 약 24개 아미노산 잔기로 출발하고;
CDR-L1 서열 이전의 잔기는 항상 시스테인(C)이며;
CDR-L1 서열 이후의 잔기는 항상 트립토판(W) 잔기이고, 전형적으로는 Trp-Tyr-Gln(W-Y-Q)이지만, 추가로 Trp-
Leu-Gln(W-L-Q), Trp-Phe-Gln(W-F-Q) 및 Trp-Tyr-Leu(W-Y-L)이며;
길이는 전형적으로 10 내지 17개의 아미노산 잔기이다.
CDR-L2 아미노산 서열의 동정:
CDR-L1의 말단 이후에 항상 16개 잔기로 출발하고:
CDR-L2 서열 이전의 잔기는 일반적으로 Ile-Tyr(I-Y)이지만, 추가로 Val-Tyr(V-Y), Ile-Lys(I-K) 및 Ile-
Phe(I-F)이며;
길이는 항상 7개의 아미노산 잔기이다.
CDR-L3 아미노산 서열의 동정:
CDR-L2의 말단 이후에 항상 33개의 아미노산으로 출발하고;
CDR-L3 아미노산 서열 이전의 잔기는 항상 시스테인(C)이며;
CDR-L3 아미노산 서열 이후의 잔기는 항상 Phe-Gly-X-Gly(F-G-X-G)(서열번호 6)이고, 여기서, X는 임의의 아미
노산이며;
길이는 전형적으로 7 내지 11개의 아미노산 잔기이다.
CDR-H1 아미노산 서열의 동정:
VH 영역의 아미노 말단으로부터 약 31개 아미노산 잔기로 및 시스테인(C) 이후에 항상 9개의 잔기로 출발하고;
CDR-H1 서열 이전의 잔기는 항상 Cys-X-X-X-X-X-X-X-X(서열번호 7)이고, 여기서, X는 임의의 아미노산이며;
CDR-H1 서열 이후의 잔기는 Trp(W)이고, 전형적으로는 Trp-Val(W-V)이지만, 추가로 Trp-Ile(W-I) 및 Trp-
Ala(W-A)이고;
길이는 전형적으로 5-7개의 아미노산 잔기이다.
CDR-H2 아미노산 서열의 동정:
CDR-H1의 말단 이후에 항상 15개의 아미노산 잔기로 출발하고;
CDR-H2 서열 이전에 잔기는 전형적으로 Leu-Glu-Trp-Ile-Gly(L-E-W-I-G)(서열번호 8)이지만, 추가로 다른 변이
도 가능하며;
공개특허 10-2012-0104542
CDR-H2 서열 이후에 잔기는
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