Auflösung des schnellen Schaltens bei Patch-Clamp Untersuchungen

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Kapitel 7: Meßergebnisse Außer bei dem Wert von Kalium bei Raumtemperatur zeigt Fig. 7.21, daß die Offenwahrscheinlichkeiten aus den beiden unabhängigen Methoden übereinstimmen. Das bedeutet, daß die Genauigkeit der bestimmten Ratenkonstanten recht gut ist. 7.3.10 Kontrolle der Ratenkonstanten der Zeitreihe aus dem Target-Fit mit der Methode des direkten Fits der Zeitreihe mit einem Hidden-Markov- Modell (HMM-Fit) Eine weitere Kontrolle für die Ratenkonstanten aus dem Targetfit ist die Analyse der Zeitreihen mit dem direkten Fit (HMM-Fit) (siehe Abschnitt 7.3.1). Wegen des hohen Zeitbedarfs dieses Fitverfahrens wurden nur vier Zeitreihen für die Analyse entnommen. Es ist zu bemerken, daß dies willkürlich herausgegriffene Einzelmessungen sind, die aufgrund der höhen Streuung nicht mit den Werten in Fig. 7.12 verglichen werden dürfen. Es kommt nur auf den Vergleich Dwell-Time-Fit und direkten Zeitreihenfit an. Es werden Zeitreihen mit höchstens zwei Stromniveaus ausgewählt. Bei höherer Anzahl des Stromniveaus dauerte der Fit einer Zeitreihe mehr als 3 Tage. Die Werte aus dem direkten Fit werden mit den Ratenkonstanten aus dem Targetfit verglichen (Tabelle 7.2). K+Tl 20 °C -60mV K+Tl 7 °C -80 mV K 20 °C -80 mV K 7 °C -80 mV Targetfit HMM-Fit Targetfit HMM-Fit Targetfit HMM-Fit Targetfit HMM-Fit kSO / Hz 7700 6600 1100 720 9800 6200 4500 4900 kOS / Hz 18500 19000 8000 7200 17500 14000 7500 7700 kOG / Hz 7100 11000 4800 17000 10200 16800 2300 2400 kGO / Hz 11500 15000 5300 7700 14500 24000 4300 4300 kGC / Hz 6200 10500 5500 7000 5200 5600 4200 3000 kCG / Hz 1500 1500 4300 600 7600 1500 3000 1000 kCZ / Hz 10 280 1100 2000 3150 4200 2200 2600 kZC / Hz 10 10 160 10 100 10 250 10 Tabelle 7.2: Vergleich der Ratenkonstanten aus dem Targetfit und dem direkten Fit mit einem Hidden- Markov-Modell im blockierten und unblockierten Zustand und bei unterschiedlicher Temperatur (20°C oder 7°C). Die meisten Ratenkonstanten aus dem HMM-Fit liegen in derselben Größenordnung wie bei dem Targetfit. Besonders für die Ratenkonstanten bei tiefer Temperatur und im unblockierten Zustand ist die Übereinstimmung erstaunlich hoch. Aber selbst bei Raumtemperatur im blockierten Zustand liegen die schnellen Ratenkonstanten aus dem HMM-Fit in derselben Größenordnung wie bei dem Targetfit. Dies zeigt, daß die Annahme, daß die schnellen Ratenkonstanten aus dem „Schwanz“ der Verteilung bestimmt werden können, zutreffen kann (siehe Abschnitt 7.3.7). Einer der schnellen Ratenkonstanten, bei der es eine große Abweichung zwischen den beiden Fitergebnissen gibt, ist kOG in der K + / Tl + - Mischlösung bei 7 °C. Das Ergebnis aus dem HMM-Fit (kOG = 17000) ist drei- bis viermal so groß wie das Ergebnis aus dem Targetfit (kOG = 4800). Das zeigt eigentlich, daß selbst bei tiefer Temperatur schnelle Ratenkonstanten existieren. Allerdings werden die größten Abweichungen bei den langsamen Ratenkonstanten beobachtet. Durch missed-events ändern sich die langsamen Ratenkonstanten am deutlichsten (Blunck et al., 1998). Diese stehen aber nicht im Vordergrund des Interesses dieser Arbeit und 75
Kapitel 7: Meßergebnisse das vorliegende Detektormaterial reicht auch nicht zur statistischen Sicherheit. Somit wird der Effekt nicht weiter untersucht. 76
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Analyse von Strom-Spannungskurven u
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6.4. Erd- und Pipettenelektrode ...
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Kapitel 1: Einleitung (1991, 1992)
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Kapitel 2: Biologische Grundlagen u
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Kapitel 2: Biologische Grundlagen u
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3 Der anomale Molfraktionseffekt Un
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Kapitel 3: Der anomale Molfraktions
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Kapitel 3: Der anomale Molfraktions
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4 Modelle für die Beschreibung der
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Kapitel 4: Modelle für die Beschre
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Kapitel 4: Modelle für die Beschre
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5 Veränderung des Schaltverhaltens
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Kapitel 5: Veränderung des Schaltv
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