Genes IX Benjamin Lewin - PortuguesBR

264 CAPÍTULO 11 TRANSCRIÇÃO
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!'i!. ,As pohmerases devem criar e romper liga ço~~ ,.. J.
Movimento
da enzima
Nucleotfdeos
fiGURA tl, U O DNA é forçado a fazer uma curva no sítio ativo
devido a uma parede protéica. Os nucleotídeos podem entrar no
sítio ativo através de um poro na proteína.
~~~·~- ---~ ~·- - ----- ~- ----
·, O sítio ativo segura a bolha de transcrição - . ·
• • I
FtGURA 11.14 A movimentação de uma polimerase de ácido
nucléico requer a quebra e a re~tauração das ligações de nucleotídeos
em posições fixas, relatívas à estrutura da enzima.
Os nucleotídeos nessas posições mudam toda vez que a enzima
move uma base ao longo do molde.
FIGURA 11.13 Uma visão expandida do sítio ativo revela a curvatura
acentuada no caminho do DNA.
raros estreitos com o substrato de ácido nucléico e o
produto, mas deve romper esses comaros e refazê-los ·
a cada ciclo de adição de nudeorídeo. Considere a
situação ilustrada na FIGURA 11.14. Uma polirnerase
realiza uma série de contatos específicos com as bases
em posições parciculares. Por exemplo, contatO "1" é
estabelecido com a base na extremidade da cadeia em
crescimento, e o comato "2" é realizado com a base
na fita molde que é complementar à próxima base a
ser adicionada. Observe, no entanto, que as bases que
ocupam esses locais nas cadeias de ácido nucléico
mudam roda ve:z. que um nucleorideo é adicionado!
Os painéis superior e inferior da figura mostram
a mesma situação: uma base está em vias de
ser adicionada à cadeia nascente. A diferença está
no fàro da cadeia nascente ter sido estendida ~;u
uma base no painel inferior. A geometria dos dois
complexos é exatamente a mesma, mas os contaros
" 1" e "2" no painel inferior são estabelecidos com
as bases nas cadeias de ácidos nucléicos localizadas
uma posição além, ao longo da cadeia. O painel
central mostra que isso deve significar que, depois
da base ser adicionada, e antes que a enzima se mova
relativamente ao ácido nucléico, os contatos feitos
em posições específicas devem ser quebrados de
forma que possam ser refeitos com as bases que
passam a ocupar essas posições após o movimento.
A estrutura da RNA polimerase sugere urna idéia
de como a enzima mantém comato com o seu substraro
enquamo quebra e refaz as ligações. Uma esrrmura
na proteína, denominada ponte, encontrase
adjacente ao sítio ativo (ver Figura 11.12). Essa
característica é encontrada tanto na enzima bacte-