Genes IX Benjamin Lewin - PortuguesBR

11.6 A RNA POLIMERASE BACTERIANA CONSI STE EM MÚLTIPLAS SUBUNIDADES 265
riana como de levedura, mas exibe diferentes formas
nas diferentes estruturas cristalinas. Em uma,
esta é dobrada, e em outra, é reta. A FIGURA 11.15
sugere que a mudança na conformação da estrurura
da ponte está estreitamente relacionada à translocação
da proteína ao longo do ácido nucléico.
No início do ciclo de translocação, a pome apresenta
uma conformação rera, adjacente ao sírio de
entrada do nucleotídeo. Isso permite que o próximo
nucleotídeo se ligue ao sírio de entrada do nucleotídeo.
A pome está em conrato com o nucleotídeo recém-adicionado.
A proteína então se move um par de
bases ao longo do substrato. A pome muda sua conformação,
dobrando-se para mamer concato com o
nudeotídeo recém-adicionado. Nessa conformação,
a ponte obstrui o sítio de entrada do nucleotídeo. Ao
fmal do ciclo, a ponte reassume sua conformação reta,
permitindo novamente o acesso ao sítio de entrada
do nucleotídeo. A ponte arua como uma catraca que
libera as fitas de DNA e RNA para translocação, enquanco
segura a extremidade da cadeia nasceme .
---- -·- - - --- - ·· -----
A ponte controla a entrada de nucleotídeos
RNA
Translocação de um pb
Sítio de entrada
do nucleotídeo
•••
A RNA Polimerase Bacteriana
Consiste em Múltiplas
Subunidades
Conceitos Essenciais
• O cerne das RNA polimerases bacterianas são complexos
de múltiplas subunidades de -500 kOa, com a estrutura
geral ~pJ3'.
• O ONA é ligado em um canal e estabelece contatos com
as subunidades p e j3'.
As RNA polimerases mais bem caracterizadas são
aquelas de eubactérias, das quais J:::Scherit·hia colí é
um caso típico. Em uma eubactéria, um único tipo
de RNA polimerase parece ser responsdvel por quase
toda síntese de mRNA, e de todo r RNA e tRNA. Cerca
de 7.000 moléculas de RNA polimerases estão
presentes em uma célula de E. coli. Muitas destas
estão e ngajadas na rranscrição; provavelmente,
2.000 a 5.000 enzimas estão sintetizando RNA a
qualquer momento, com esse mímero dependendo
das condições de crescimento.
A enzima completa ou holoenzima em E. coli
possui uma massa molecular de ~465 kDa. Sua composição
de subunidades está resumida na FIGURA
11.16.
As subunidades ~ e W em conjunto compõem o
centro catalítico. Suas seqüências estão relacionadas
às maiores subunidades da RNA polimerase eucariótica.
(ver Seção 24.2, As RNA Polimerases Eucarióticas
Consistem em Várias Subunidades), sugerindo a
existência de características comuns em relação às ati-
FIGURA 11.15 O ciclo de elongação da RNA polimerase é iniciado
com uma ponte reta adjacente ao sítio de entrada dos
nucleotídeos. Após a adição de um nucleotídeo, a enzi ma movese
por um par de bases, e a ponte dobra-se à medida que estabelece
contato com o nucleotídeo recém-adicionado. Quando a
ponte é liberada, o ciclo pode, então, recomeçar.
vidades de rodas as RNA polimerases. A subunidade
~ pode ser ligada cruzadamentc ao ONA molde, ao
produto de RNA e aos ribonucleorídeos substratos;
mutações em 1poB afetam rodos os estágios da trans­
também
crição. Mutações em rpoC revelam que~ ·
está envolvida em todos os estágios.
A subunidade a é requerida para a montagem
da em.ima cerne. Quando o fago T 4 infecta E. co/i,
a subunidade a é modificada pela ADP-ribosilação
de uma arginina. A modificação está associada
com uma afinidade reduzida pelos promotores inicialmente
reconhecidos pela holoenzima, sugerindo
que a subunidade a desempenha um papel na
imeração da RNA polimerase com alguns fatores
regulatórios.