Genes IX Benjamin Lewin - PortuguesBR

620 CAPÍTU LO 24 PROMOTORES E INTENSIFICADORES
Promotores
de pollll
/ANA polimerase 111
Promotores
de poli
FIGURA 24.12 Uma visão de uma seção transversal revela que
TBP envolve o DNA a partir da face do sulco menor. TBP consiste
em dois domínios conservados relacionados ( 40% de identidade),
ilustrados em azul-claro e escuro. A região N-terminal
varia amplamente, estando ilustrada em verde. As duas fitas da
dupla hélice do DNA são apresentadas em cinza-claro e escuro.
Fotografia gentilmente cedida por Stephen K. Burley.
/ANA poli me rase I
i-A TBP Liga-se ao DNA de
Forma Incomum
Promotores
de polll
+10 +20
FIGURA 24.11 As RNA polimerases são posicionadas em todos
os promotores por um fator que contém TBP.
tras proteínas que se ligam ao DNA. Qualquer que
seja sua forma de entrada no complexo de iniciação,
esta apresenta o objetivo comum de interação com a
RNA polimerase.
TFuD é ubíquo, mas não único. Todos os eucarioros
multicelulares também expressam um complexo
alternativo, o qual apresenta TLF (um fator similar
a TBP), ao invés de TBP. Um TLF tipicamente
apresenta ~60% de similaridade com TBP. Este provavelmente
inicia a formação do complexo por meio
do usual conjunro de fatores TFw No entanto, TLF
não se liga ao TATA box, e não sabemos ainda como
este atua. Drosophila também possui um terceiro faror,
TRFl, o qual atua da mesma forma que TBP e se
liga a seu próprio conjunto de TAFs, formando um
complexo que atua como uma alternativa a TF 11
D em
um conjunto específico de promotores.
Conceitos Essenciais
• A TBP liga-se ao TATA box no sulco menor do DNA.
• Esta forma uma sela ao redor do DNA e dobra-o em -80°.
• Alguns dos TAFs assemelham-se a histonas e podem formar
uma estrutura semelhante a um octâmero de histona.
TBP apresenta a propriedade incomum de ligar-se ao
DNA no sulco menor. (Virtualmente, todas as proteínas
de ligação a DNA ligam-se no sulco maior.) A
estrutura cristalina de TBP sugere um modelo detalhado
de sua ligação ao DNA. A FIGURA 24.12 revela
que esta envolve uma face do DNA, formando uma
"sela'' ao redor da dupla hélice. De fato, a superfície
interna de TBP liga-se ao DNA, e a superfície externa
maior encontra-se disponível para estender os contatos
a outras proteínas. O sítio de ligação ao DNA consiste
em um domínio C-terminal, conservado entre
as espécies, e a cauda N-terminal variável encontra-se
exposta para interagir com outras proteínas. O faro
da seqüência de ligação ao DNA de TBP ser 80%
conservada entre levedura e seres humanos corresponde
a uma medida da conservação do mecanismo na
iniciação transcrícional.
A ligação de TBP pode ser inconsistente diante
da presença de nucleossomos. Os nudeossomos são
formados preferencialmente pelo posicionamento
de seqüências ricas em A-T com os sulcos menores
voltados para o interior; como resultado, estes poderiam
impedir a ligação de TBP. Isto pode explicar
porque a presença de nucleossomos impede a
iniciação da transcrição.