Scuola di Dottorato di Ricerca in Parodontologia Sperimentale

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Figura 16: Mappa Finale di tutti i geni coinvolti nel processo di rimodellamento osseo, in accordo con STRING. I geni leader e i geni appartenenti al cluster B appaiono rossi, i geni orfani grigi. Le linee che connettono i singoli geni rappresentano le associazioni funzionali previste tra le proteine. All'aumentare del numero di cluster, l'algoritmo di raggruppamento Kmeans ha fornito un numero stazionario di geni appartenenti al gruppo dei geni leader, per entrambi i processi analizzati (Figure 17 e 18). Il metodo del gap statistico ha permesso di stimare il numero dei cluster K, pari a 11 nel processo d’incremento osseo e pari a 7 nel fenomeno di rimodellamento osseo (Figure 19 e 20). Escludendo il cluster dei geni leader e quello dei geni orfani, gli altri cluster sono stati definiti con lettere progressive B, C, etc. fino alla lettera J, nel processo di incremento osseo, e, fino alla lettera F, nel processo di rimodellamento osseo. 67
Figura 17: Geni appartenenti al cluster leader in diversi esperimenti con l’algoritmo Kmean con un crescente numero di cluster, nel processo di incremento osseo. Figura 18: Geni appartenenti al cluster leader in diversi esperimenti con l’algoritmo Kmean con un crescente numero di cluster, nel processo di rimodellamento osseo. 68
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UNIVERSITÀ DEGLI STUDI MILANO-BICO
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