Scuola di Dottorato di Ricerca in Parodontologia Sperimentale
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Discussioni Fase Analisi Genica<br />
Numerosi stu<strong>di</strong> hanno <strong>di</strong>mostrato che fattori <strong>di</strong>versi, quali l'ultrastruttura,<br />
la morfologia, l'orientamento e l'orig<strong>in</strong>e embriologica dell'<strong>in</strong>nesto osseo,<br />
<strong>in</strong>fluenzano il risultato delle procedure <strong>di</strong> <strong>in</strong>cremento del volume osseo e,<br />
<strong>di</strong> conseguenza, del processo <strong>di</strong> rimodellamento 40,41,42 , che, a sua volta,<br />
può essere <strong>in</strong>fluenzato anche dalla natura dei materiali da <strong>in</strong>nesto<br />
utilizzati 35,43 .<br />
Poiché, <strong>in</strong>oltre, molti fattori <strong>in</strong>duttivi durante le procedure ricostruttive<br />
sono <strong>in</strong> grado <strong>di</strong> stimolare l’<strong>in</strong>cremento locale <strong>di</strong> volume osseo, si ritiene<br />
che esista una base genetica non ancora determ<strong>in</strong>ata, decisiva sia nel<br />
processo <strong>di</strong> <strong>in</strong>cremento che <strong>di</strong> rimodellamento osseo 44 .<br />
I geni co<strong>in</strong>volti nei due fenomeni descritti sono stati identificati attraverso<br />
un approccio <strong>di</strong> estrazione dei dati: il complesso prelim<strong>in</strong>are <strong>di</strong> geni,<br />
tuttavia, ottenuto me<strong>di</strong>ante una ricerca nei database e me<strong>di</strong>ante l’analisi<br />
delle liste <strong>di</strong> geni provenienti da microarray <strong>di</strong>sponibili <strong>in</strong> commercio, si<br />
avvic<strong>in</strong>ava al numero f<strong>in</strong>ale dei geni rilevati (approssimativamente 75% <strong>in</strong><br />
entrambi casi). I tre cicli <strong>di</strong> processi <strong>di</strong> espansione e filtrazione, eseguiti<br />
f<strong>in</strong>o alla convergenza dei dati, hanno condotto alla scoperta dei rimanenti<br />
geni co<strong>in</strong>volti nei due fenomeni: è chiara, qu<strong>in</strong><strong>di</strong>, l'importanza rivestita<br />
dall'alternarsi dei processi <strong>di</strong> espansione e filtrazione per la corretta analisi<br />
dei fenomeni.<br />
Il software STRING ha fornito <strong>in</strong>formazioni circa le associazioni comb<strong>in</strong>ate<br />
previste, con un elevato livello <strong>di</strong> confidenza (≥0.9), ottenute dalla<br />
comb<strong>in</strong>azione <strong>di</strong> database riguardanti l'<strong>in</strong>terazione fisica <strong>di</strong>retta prote<strong>in</strong>a–<br />
prote<strong>in</strong>a, l'espressione genica sperimentale, cioè il suo ruolo attivo nelle<br />
vie metaboliche, e le associazioni funzionali <strong>in</strong><strong>di</strong>rette.<br />
Per ciascuno dei due fenomeni, i geni sono stati classificati <strong>in</strong> base al<br />
numero pesato <strong>di</strong> <strong>in</strong>terazioni (WNL) con gli altri geni dello stesso set <strong>di</strong> dati<br />
e, me<strong>di</strong>ante il metodo del gap statistico, applicato all'analisi K-means, è<br />
stato calcolato il numero f<strong>in</strong>ale <strong>di</strong> cluster.<br />
Stu<strong>di</strong> precedenti 2,3 avevano accertato il ruolo specifico giocato da limitati<br />
set <strong>di</strong> geni nel ciclo cellulare dei l<strong>in</strong>fociti-T umani e nella malattia<br />
parodontale.<br />
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