Scuola di Dottorato di Ricerca in Parodontologia Sperimentale

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Figura 19: Plot del metodo del gap statistico per individuare il numero di cluster K, nel processo di incremento osseo. Figura 20: Plot del metodo del gap statistico per individuare il numero di cluster K, nel processo di riassorbimento osseo. 69
È stato individuato solo un gene appartenente al cluster dei geni leader nel processo di incremento osseo, mentre nel processo di rimodellamento osseo ne sono stati individuati 3. Il test di Kruskal-Wallis ha ulteriormente confermato i risultati, rilevando differenze statisticamente significative tra i differenti cluster, cluster dei geni leader, cluster B, cluster C, etc., sia nel fenomeno di incremento che nel fenomeno di rimodellamento osseo. Processo di incremento osseo Nel processo di incremento osseo, l’analisi a cluster dei dati ha indicato la presenza di un solo gene leader (VEGFA) e di 6 geni appartenenti al gruppo B. 42 geni, di cui non sono state rilevate interazioni, sono stati definiti geni orfani. La valutazione delle citazioni in letteratura, nell’analisi gsc a dei geni appartenenti al cluster dei geni leader e al cluster B ha rivelato che solo per tre su sette dei geni trovati era noto un legame col processo di incremento osseo. I geni dei cluster superiori caratterizzati da un numero basso di citazioni sono: IL6 (o HSF) (gsc a = 11), RUNX2 (gsc a = 9), FOS (gsc a = 4), IL1B (gsc a = 6). Processo di rimodellamento osseo Nel processo di rimodellamento osseo sono stati individuati 3 geni leader, JUN, IL6 (o HSF) e TNF- α (o TNF). Sono stati trovati 6 geni appartenenti al cluster B e 31 geni orfani. La ricerca di citazioni riguardanti l'analisi dei geni appartenenti al cluster dei geni leader e al cluster B ha rivelato che solamente il ruolo di TNF- α era già conosciuto nel processo di rimodellamento dei tessuti duri. I geni caratterizzati da valori di gsc r relativamente bassi erano IL2 (gsc r = 3), MAPK8 (gsc r = 0), TGFB1 (o CED) (gsc r = 11) e IL1B (gsc r = 8), tutti appartenenti al cluster B. La Tabella 11 mostra i punteggi specifici sia per i geni leader che per i geni del cluster B per entrambi i gruppi: nel gruppo incremento osseo, i 70
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