situ hibridizasyon yöntemi i - Çukurova Üniversitesi
situ hibridizasyon yöntemi i - Çukurova Üniversitesi
situ hibridizasyon yöntemi i - Çukurova Üniversitesi
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
FISH testinin değerlendirilmesi:<br />
Sonuçların değerlendirilmesinde üreticinin önerdiği FISH testi protokolü<br />
kullanıldı. Floresan mikroskopta değerlendirme esnasında H&E kesitlerle karşılaştırarak<br />
lezyon oryantasyonu sağlandı. Bir patolog tarafından en az üç farklı alandaki 30<br />
melanosit nükleusu, olgunun histopatolojik tanısı bilinmeden skorlandı. Sinyali<br />
olmayan veya sağlıklı değerlendirme için yeterince kuvvetli sinyali olmayan olgular<br />
değerlendirmeye alınmadı. Her nükleustaki kırmızı, sarı, yeşil ve mavi sinyaller karşılık<br />
geldikleri RREB (kırmızı), MYB (sarı), CCND1 (yeşil) ve CEP 6 (mavi) genlerin kopya<br />
sayılarına göre kaydedildi. Sonuç olarak aşağıda cutt-of değerleri belirtilen dört<br />
parametre hesaplandı. En az bir parametre cutt-of değerinin üzerinde ise FISH testi<br />
pozitif olarak kabul edildi.<br />
1. Her nükleustaki ortalama CCND1 sinyali (≥2,5)<br />
2. Her nükleustaki ortalama MYB sinyali (≥2,5)<br />
3. Anormal sinyalli RREB nükleuslarının yüzdesi (≥% 63)<br />
4. CEP6’ya göreceli MYB kaybı olan nükleusların yüzdesi (≥%31)<br />
İstatistiksel analiz: Sinyal parametrelerinin prognozu belirlemedeki rolünü<br />
incelerken her bir sinyalin pozitif veya negatif değer alanlarının yaşam eğrileri Kaplan<br />
Meier <strong>yöntemi</strong> ile elde edildi ve grafikle gösterildi. Bu yaşam eğrileri dağılımının aynı<br />
veya farklı olup olmadığı Log- rank testleri ile test edildi. Ayrıca tanı testlerinin<br />
herbirinin prognozu belirlemedeki rolü Cox-regression analizi ile değerlendirildi. Elde<br />
edilen p değerinin 0,05’ten küçük değerler için yaşam eğrilerinin anlamlı olduğu; 0,05-<br />
0,10 arasındaki değerler için farklılığın sınırda olduğu kabul edildi. Ayrıca tanı<br />
testlerinin her birinin prognozu belirlemedeki rolü Cox-regression analizi ile<br />
değerlendirildi.<br />
Histolojik gruplarda orijinal sinyal ölçümlerinin özetlenmesi Box-Plot grafiği ile<br />
gösterildi. Gruplarda sinyallerin farklı olup olmadıkları parametrik (one way ANOVA)<br />
veya nonparametrik alternatifi Kruska Wallis testi ile belirlendi. Önemli olanlardan ikili<br />
farklılıklar Mann Whitney testi ile saptandı.<br />
Dört ayrı sinyal ile klinikopatolojik değişkenler arasındaki ilişkinin<br />
belirlenmesinde ki-kare analizleri kullanılmıştır. İstatistiksel olarak önemli anlamlılık<br />
p’nin 0,05’ten küçük değerleri kabul edildi.<br />
43
Change language