6.2 中药学（H28） - 国家自然科学基金委员会医学科学部

基 因 芯 片 用 于 中 药 作 用 机 制 研 究 的 数 据 重 现 性 问 题 分 析项 目 批 准 号 : 30801556项 目 负 责 人 : 范 骁 辉依 托 单 位 : 浙 江 大 学作 为 系 统 生 物 学 的 重 要 研 究 手 段 之 一 , 基 因 芯 片 已 被 大 量 用 于 中 药 作 用 机 制 研 究 等 领域 。 但 芯 片 数 据 的 重 复 性 、 再 现 性 及 不 同 平 台 结 果 的 可 比 性 等 具 体 技 术 问 题 仍 然 存 在 争 议 ,制 约 了 基 因 芯 片 技 术 在 中 医 药 学 研 究 中 的 进 一 步 推 广 。 本 课 题 选 择 黄 芪 丹 参 方 治 疗 大 鼠 急 性心 肌 梗 塞 机 制 研 究 为 具 体 模 式 对 象 , 用 Affymetrix、Agilent 和 Illumina 等 三 个 最 常 用 的 芯 片 分析 平 台 , 分 别 考 察 给 药 组 、 模 型 组 和 假 手 术 组 芯 片 数 据 的 平 台 内 重 复 性 、 再 现 性 以 及 不 同 平台 结 果 的 可 比 性 , 并 回 溯 分 析 各 实 验 操 作 和 数 据 分 析 环 节 对 结 果 的 影 响 , 以 期 为 基 因 芯 片 技术 用 于 中 药 作 用 机 制 研 究 提 供 实 际 指 导 。 本 项 目 的 实 施 结 果 ( 不 论 是 正 面 还 是 反 面 ) 将 是 对生 物 芯 片 质 量 控 制 (MAQC) 国 际 合 作 计 划 的 重 要 补 充 , 有 助 于 完 善 芯 片 技 术 , 拓 展 和 丰 富中 医 药 研 究 手 段 , 从 而 推 动 和 加 快 中 药 作 用 机 制 等 相 关 研 究 进 程 。关 键 词 : 生 物 芯 片 ; 数 据 重 现 性 ; 黄 芪 丹 参 方 ; 中 药 作 用 机 制 研 究发 表 论 著 :1. Fan, Xiaohui, Shi, Leming, Fang, Hong, Cheng, Yiyu, Perkins, Roger, Tong, Weida. DNAMicroarrays Are Predictive of Cancer Prognosis: A Re-evaluation. Clinical Cancer Research,2010, 16(2):629-6362. Fan, X., Lobenhofer, E. K., Chen, M., Shi, W., Huang, J., Luo, J., Zhang, J., Walker, S. J.,Chu, T-M, Li, L., Wolfinger, R., Bao, W., Paules, R. S., Bushel, P. R., Li, J., Shi, T.,Nikolskaya, T., Nikolsky, Y., Hong, H., Deng, Y.Consistency of predictive signature genesand classifiers generated using different microarray platforms. Pharmacogenomics Journal,2010, 10(4):247-2573. Fan, Xiaohui, Shao, Li, Fang, Hong, Tong, Weida, Cheng, Yiyu. Cross-Platform Comparisonof Microarray-Based Multiple-Class Prediction. PLoS One, 2011, 6(1):e160674. Shao, Li, Wu, Leihong, Fang, Hong, Tong, Weida, Fan, Xiaohui. Does Applicability DomainExist in Microarray-Based Genomic Research. PLoS One, 2010, 5(6):e110555. Huang, J., Shi, W., Zhang, J., Chou, J. W., Paules, R. S., Gerrish, K., Li, J., Luo, J., Wolfinger,R. D., Bao, W., Chu, T-M, Nikolsky, Y., Nikolskaya, T., Dosymbekov, D., Tsyganova, M.449