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Le calcul de la densité s’exprime par la formule suivante : D = Ni*R*1000/v D = densité en nombre d’individus par litre Ni = moyenne du nombre d’individu d’une espèce R = rapport entre la surface de la cellule de comptage et la surface du champ oculaire 1000 = facteur de conversion en litre v = volume d’échantillon sédimenté en ml (5 ml généralement) 4-3-2-2) Biovolume Notion de Biovolume Le volume et la surface des unités de comptage ont été calculés en utilisant des combinaisons de formules géométriques simples, en approchant le plus possible les différentes espèces phytoplanctoniques des formes géométriques connues d’après les formules décrites par DIA & REYNAUD (1982). Les dimensions (diamètre des cellules, diamètre des colonies et des coenobes, longueur et diamètre des filaments…) sur un nombre variable d’unités de comptage sont mesurées à l’aide de la caméra DP 50 adaptée sur le microscope inversé OLYMPUS et d’un logiciel de traitement d’image (ANALYSIS). Ainsi : Pour les formes sphériques, on a V = 4 x p x r 3 /3 et S = 4 x p x r 2 Pour les formes cylindriques, on a V = p x r 2 x h et S = (2 x p x r x h) + (2 x p x r 2 ) Pour les formes pyramidales, on a V = p x r 2 x h/3 et S = (2 x p x r x apothème/2) + (p x r 2 ) Pour les autres formes géométriques complexes, nous nous sommes inspirés des travaux de SUN & LIU (2003). Calcul du biovolume L’estimation du biovolume total est approchée par le calcul du volume plasmique cellulaire suivant la formule de SMAYDA (1965) : Vp = (S x E) + (0,1 x V) avec Vp volume plasmique (µm 3 ), S : surface cellulaire (µm 2 ), E : épaisseur du cytoplasme pariétal, évalué en fonction du rapport Surface/Volume S/V < 0,35 = 2 ; S/V de 0,36 à 0,5 = 1,5 ; S/V de 0,51 à 0,89 = 1 ; Si S/V> 0,90 le volume plasmique est alors égal au volume total Le biovolume total d’une espèce est obtenu en multipliant le biovolume moyen d’un organisme par son effectif total. Pour la commnunauté phytoplanctonique, le biovolume total est la somme de tous les biovolumes spécifiques, exprimé en mm 3 /l. 39
Contribution spécifique Les estimations de dominance ont été faites soit à partir des effectifs ou des biovolumes grâce aux deux formules suivantes : Dm = Dsp /DT*100 Dm = Bvsp /BvT*100 Dm = dominance en pourcentage ; Dsp = densité spécifique ; DT= densité totale ; Bvsp = biovolume spécifique ; BvT = biovolume total Les espèces dominantes aussi bien en terme d’effectif que de biovolume ont été définies en choisissant celles qui ont un pourcentage supérieur à 5%. 4-3-3 Analyse des données L’ensemble des résultats a été traité dans un premier temps avec le logiciel Excel. Les représentations graphiques ont été réalisées avec les logiciels Sigma plot 2000 et Quattro Pro-9. Les analyses statistiques (ANOVA, test de Bonferroni) ont été réalisées avec le logiciel Sigma Stat 2.0. Les analyses de données (Analyses en Composantes Principales et Analyses en co-inertie) ont été développées avec le logiciel ADE4 (THIOULOUSE et al., 1997) sous R. 40
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7) CONCLUSION GENERALE L’un des o
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8) REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES Alle
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Couté A. & Chauveau O., 1994. Alga
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Havens K.E., Phlips E., Cichra M. &
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Robarts R.D. & Southall G.C., 1977.
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Wetzel R. G., 2001. Limnology : Lak
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M aeruginosa R lineare Mo circinali
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