Programme et résumés (pdf) - Société statistique du Canada

Dimanche 28 mai • Sunday, May 28, 19:00–21:00 63[MS-5]A New R Package for Biostatistics, Public Policy and LawUne nouvelle logithèque R pour la biostatistique, les politiques d’intérêt public et le domaine judiciaireWai Lok Wallace HUI & Yulia R. GEL, University of Waterloo, Joseph GASTWIRTH, George Washington University,Weiwen MIAO, Macalester CollegeWe present a new R software package on statisticaltests widely utilized in biostatistics, public policyand law. Along with well-known but not implementedtests on serial correlation such as theBartels test, the package contains new distributionfreerobust tests of symmetry; omnibus and directionaltests of normality which are more sensitive toheavy tailed alternatives, and their graphical counterpartssuch as Robust QQ plot; measures of relativevariability (Gini Index, Coefficient of Dispersion,Lorenze curve); tests of homogeneity of severalsample proportions. All implemented tests andmethods are illustrated by simulations and real-lifeexamples from legal statistics, economics and biostatistics.Nous présentons un nouveau progiciel de R sur les testsstatistiques largement utilisés en biostatistiques, en poli-tiques d’intérêt public et dans le domaine judiciaire. Avecles tests bien connus mais non mis en application surl’autocorrélation tel que le test de Bartels, le progicielcontient de nouveaux tests robustes non paramétriques dela symétrie ; tests composites et directionnels de la nor-malité qui sont plus sensibles aux solutions de rechange àaile lourde, et leurs contreparties graphiques telle que unQQ plot robuste ; mesures de variabilité relative (indice deGini, coefficient de dispersion, courbe de Lorenze) ; testd’homogénéité de plusieurs proportions d’échantillon. Tousles tests et les méthodes mis en application sont illustréspar des simulations et des exemples réels provenant des do-maines des statistiques légales, des sciences économiques etde la biostatistique.[MS-6]Quality Assessment for Microarray Gene Expression DataÉvaluation de la qualité de données d’expression génétique mesurées par micro pucesJulia BRETTSCHNEIDER, Queen’s University, François COLLIN, Affymetrix Inc., Ben BOLSTAD, University of Californiaat Berkeley, Terence SPEED, University of California at Berkeley & Walter and Eliza Hall Institute, AustraliaMicroarrays have become an established instrumentfor measuring tool for measuring the bio-Les micropuces sont devenus un instrument bien établi dansla mesure simultané de l’activité biochimique de milliers dechemical activity of thousands of genes simultane- gènes. L’étude de la composante génétique dans l’étiologieously. Among the many applications are studies de maladies complexes comme le cancer et la schizophrénieof the genetic components in the etiology of com- fait partie de ses multiples applications. Malgré une amélioplexdiseases such as cancer or schizophrenia. De- ration technique, l’absence d’exactitude et de précision despitetechnical improvement, the lack of accuracy meure caractéristique des données provenant de micropuces.and precision remains a characteristic of microar- Il y a un besoin urgent de repères à fins de reproductibiraydata. Benchmarks for reproducibility are ur- lité. Nous introduisons des métriques de qualité et des ougentlyneeded. We introduce quality metrics and tils d’évaluation visuelle de la qualité pour les micropuces àvisual quality assessment tools for short oligonu- oligonucléotides courts. Ils sont testés sur des données excleotidemicroarrays. They are tested on experi- périmentales et comparés au rapport de qualité commercial.mental data and compared them with the commer- Notre évaluation est basée sur les sous-produits obtenus lorscial quality report. Our assessment is based on du pré-traitement statistique par RMA/fitPLM.byproducts obtained by statistical preprocessing byRMA/fitPLM.SH = Somerville House SSC = Social Science Centre UC = University College