Grafiken und Statistik in R

4.4 Clusteranalyse
4 Statistik
7. Not removing the effect of correlations among descriptors: . . . . . coefficient of racial likeness (D12)
� Im folgenden beim Bestimmen von Abhängigkeiten von Deskriptoren (R - Modus)
1. Descriptors: species abundances
2. Descriptors: presence-absence
3. Coefficients without associated probability levels: 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3. Probabilistic coefficient: 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2. Descriptors: multistate
4. Data are raw abundances: . . . . . . . . . χ 2 similarity (S21), χ 2 metric (D15), χ 2 distance (D16),
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hellinger distance (D17), Spearman r, Kendall τ
4. Data are normalized abundances
5. Coefficients without associated probability levels:
covariance or Pearson r, after elimination of as much double-zeros as possible,
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Spearrnan r, Kendall τ
5. Probabilistic coefficients:
probabilities associated to Pearson r, Spearman r or Kendall τ,
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Goodall coefficient (S23)
1. Descriptors: chemical, geological, physical, etc.
6. Coefficients without associated probability levels
7. Descriptors are quantitative and linearly related: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . covariance, Pearson r
Descriptors are ordered and monotonically related: . . . . . . . . . . . . . . . . . Spearman r, Kendall τ
7. Descriptors are qualitative or ordered but not monotonically related:
χ 2 , reciprocal information coefficient, symmetric uncertainty coefficient
6. Probabilistic coefficients
8. Descriptors are quantitative and linearly related: . . . . . . probabilities associated to Pearson r
Descriptors are ordered and monotonically related:
probabilities associated to Spearman r and Kendall τ
8. Descriptors are ordered and monotonically related: . . . . . . . . . . . . probabilities associated to χ 2
Für die in Tabelle 3 auf der nächsten Seite stehenden Gleichungen gilt für presence-absence Daten:
Art 1
Art 2
1 0
1 a b
0 c d
, wobei mit p gemeint ist: p = a + b + c + d
Für quantitative Distanzmaße soll das folgende Beispiel die Bedeutung der Buchstaben A, B und W
verdeutlichen:
Artabundanzen A B W
Probe x1 7 3 0 5 0 1 � 16
Probe x2 2 4 7 6 0 3
Minimum 2 3 0 5 0 1
22 in Legendre und Legendre (1998) steht an dieser Stelle nichts: ?Duckfehler oder gemeint siehe weiter unten bei „Coefficients
110
without associated...“
� 22
� 11