Grafiken und Statistik in R

4 Statistik
# Schwerpunkt jeder Gruppe (Zentroid) - ordispider(...)
ordispider(mod, Moisture ,col="red")
� Moisture gibt den zu zeichnenden Faktor an; Optionen: display = "sites" oder display = "species" möglich.
# Clustergruppen – ordicluster(...)
plot(mod, type = "p", display="sites") # Punkte einzeichnen
ordicluster(mod, hclust(vegdist(dune)), prune=3, col = "blue")
4.5 Ordinationsmethoden
� Optionen: prune=3 – prune=0 alle Gruppen verbinden, prune=1 Trennung in der ersten Hierarchie (also 2 Gruppen), prune=3 Trennung
in der 3. Hierarchie (also mindestens 3 Gruppen); hierarchische Clusteranalysen mit package hclust und agnes möglich (s.S.)
# Verteilung als Ellipse zeichnen – ordiellipse(...)
ordiellipse(mod, Moisture, kind="sd", conf=0.95, lwd=2, col="blue")
� Moisture gibt den zu zeichnenden Faktor an; Optionen: kind="sd" – "sd" Standardabweichung der Punkte oder Standardfehler wird
verwendet; conf=0.95 Vertrauensintervall manuell festlegen.
detach(package:vegan) # Paket wieder entfernen
Randbeschriftungen von Arten/Proben in einem Ordinationsdiagramm, die recht übersichtlich aussieht geht
mit linestack(...):
data(dune)
?dune # Hilfe zum Datensatz
ord