Grafiken und Statistik in R

4 Statistik
4.5 Ordinationsmethoden
Tabelle 5: Verschiedene Methoden bei der PCA mit der Funktion pca(a, method=3), aus der Hilfe
pca(a, method=3)
1 keine Transformation
2 Zentrierung auf Null durch den Mittelwert
3 Zentrierung auf Null durch den Mittelwert sowie Standardisierung
4 Beobachtungen normalisiert durch Intervallgrenzen der Variablen und Varianz/Kovarianzmatrix wird
verwendet
5 rechnen mit einer Kendall (rank-order) Korrelationsmatrix
6 rechnen mit einer Spearman (rank-order) Korrelationsmatrix
7 rechnen mit einer Kovarianzmatrix
8 rechnen mit einer Korrelationsmatrix
4.5.2 RDA - linear, direkt & partiell
library(vegan) # package laden
data(dune) # Species Daten einlesen
?dune # Hilfe zum Datensatz
data(dune.env) # Umweltdaten einlesen
?dune.env # Hilfe zum Datensatz
Hinweis: method=3 und method=8 liefern identische Ergebnisse
� Wenn man selbst Daten einliest: darauf achten, daß Reihen und Spalten auch als Variablen eingelesen werden durch header=TRUE,
row.names=1 in read.table() fora