Rasterkraftmikroskopische Untersuchungen an nativen biologischen ...

PROJEKTE UND ERGEBNISSE
3 Sucroseporin, Abbildung am SFM
Abbildung 38: Unidirektional rekonstituiertes ScrY, extrazelluläre Seite exponiert. (LP R = 0, 25; Lipid:
DMPC; Messpuffer: 250 mM LiCl, 2 mM MgCl 2 , 10 mM Tris/HCl pH 7,6).
Aufnahme erfolgte bei pH 6, was insofern von Belang ist, da die Oberflächenladungsdichte von
Siliziumnitrid-Spitzen pH-abhängig ist (s. 3.4.1). Die Auflagekraft wurde ebenso minimiert wie
bei den übrigen Messungen. Die Höhendifferenz von den Protrusionen zum Trimerzentrum beträgt
hier etwa 3,5 Å.
Näheren Aufschluss über die Beziehungen der beiden auf der extrazellulären Seite abgebildeten
Varianten liefern Messungen wie Abb. 41, wo in demselben Membranfragment in unmittelbar
benachbarten Domänen einer kristallin mit ScrY gepackten Membran beide Formen abgebildet
wurden. Die beiden Bereiche können als unidirektional extrazellulär exponiert betrachtet werden,
da die für bidirektionalen Einbau beobachtete und auch dem Modell entsprechende typische Stufe
von über 1 nm fehlt und beide Varianten sich deutlich von der oben beschriebenen periplasmatischen
Seite unterscheiden. Es handelt sich in Abb. 41 um die einschichtig adsorbierte Membran
eines für dieses LPR typischen, relativ kleinen und unidirektional mit ScrY bepackten Vesikels.
Translationales Korrelationsalignment mit einer Referenz, die eine Triade von nahe beieinanderliegenden
Protrusionen im Zentrum enthält, ergab bei der Mittelung zweier Untergruppen (SPIDER:
Funktion WV P „patch averages“) aus den in Abb. 41 A umrahmten Bereichen deutliche Unterschiede.
Der linke Bereich ergibt ein mit der Referenz konsistentes Mittel (Abb. 41 D 1 ), während
im rechten Mittel (Abb. 41 D 2 ) sich dies mit Bildern der ringartigen Form überlagert. Typisch ist
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