Rasterkraftmikroskopische Untersuchungen an nativen biologischen ...

PROJEKTE UND ERGEBNISSE
3 Sucroseporin, Abbildung am SFM
Abbildung 42: (vorherige Seite) Dasselbe Präparat wie Abb. 41, x p = 4, 06 Å). A: Rohdaten links,
B: Translationale Korrelationsfunktion (zu A, C) mit markierten Korrelationsmaxima (schwarze Punkte).
C: Referenz zu A, B. D: Mittel (Wertebereich: 3,4 Å) aus A, B, C mit Standardabweichungskarte (Wertebereich:
0,8 - 1,7 Å) und Varianzkarte. N = 53. E: D, maskiert. F: geradzahliges und ungeradzahliges
Mittel aus D für Abschätzung der Auflösung. G: Referenzfreies Alignment der vorselektierten Rohdaten,
letztes Mittel daraus (Wertebereich: 3,4 Å) mit SD-Karte (Wertebereich: 0,7 - 1,5 Å) und Varianzkarte.
H: Rohdaten rechts, I: Translationale Korrelationsfunktion mit markierten Korrelationsmaxima (zu H, K).
K: Referenz zu H, I. L: Mittel (Wertebereich: 3,2 Å) aus H, I, K mit Standarabweichungs- (Wertebereich:
0,7 - 1,6 Å) und Varianzkarte. N = 60. M: L, maskiert. N: geradzahliges und ungeradzahliges Mittel aus
M. O: Referenzfreies Alignment der vorselektierten Rohdaten, letztes Mittel daraus (Wertebereich: 3,1 Å)
mit SD-Karte (Wertebereich: 0,8 - 1,6 Å) und Varianzkarte. Maßstab A-O: vgl. Kantenlänge C-F, K-N:
20,3 nm, G, O: 12,6 nm.
Abbildung 43: Abstände zwischen den exponiertesten extrazellulären Loops benachbarter Monomere innerhalb
des Trimers (Röntgenstruktur): starrer Loop 8 an der periperen Wand des Barrels (41,5 Å) und
flexibler Loop 5 (25,3 Å). Die Sterne markieren den oberen Rand der peripheren Wand des Barrels (Abstand
der C α 371, β14: 62,7 Å). Die grau hinterlegte Fläche hat eine Kantenlänge von 85 Å. Erzeugt mit O
(K. Diederichs).
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