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102 Annexe A. Fichiers d’entrée et de sortie SAPT SCF 116 21 0 1 ED3 TITLE HCOO- Ca. MFILE MT3 1 0 DIIS 20 1 0 AUTO 0 MAXCYC 60 ACCURACY 1 10 START ENTER 1 Table A.1 – Exemple de fichier scfinp dans le cas de l’interaction de l’ion formate avec le cation calcium. La première ligne correspond à des valeurs nécessaires pour le scf, respectivement, le nombre de fonctions de base (116), le nombre d’électrons sur 2 du système considéré (21), la charge globale du système (0) et le spin (1). Les autres mots-clefs sont définis pour le programme et une liste plus exhaustive peut être trouvée sur le site de Atmol 1 . La partie la plus importante de ce fichier d’entrée est le MAXCYC qui permet d’indiquer le nombre maximum de cycles pour converger la fonction d’onde (une discussion sera effectuée en A.2 sur cette partie). Le second type de fichier à considérer est nommé *.intinp. Dans celui-ci, la géométrie de l’ensemble du dimère est considérée. La structure de fichier est définie dans le tableau A.2. Les deux premières lignes du fichier correspondent au titre pour le calcul à effectuer puis nous spécifions la géométrie du système en spécifiant bien tous les atomes considérés dans le dimère. Afin de définir le monomère dans la base de l’autre monomère, il suffit 1. http://tc5.chem.uu.nl/ATMOL/scf.html
A.1. Fichiers d’entrée 103 TITLE ca2+ hcoo- GEOMETRY ANGSTROM 0.000000 0.306183 0.000000 6.0 C1 1.120462 -0.204599 0.000000 8.0 O1 -1.120339 -0.204197 0.000000 8.0 O2 0.000000 1.433262 0.000000 1.0 H1 0.0 0.306183 2.400000 20.0 CA1 END GTOS · · · END MAXBLOCK 3000000 ACCURACY 12 13 12 MAINFILE MT3 DUMPFILE ED3 IBLOCK 1 NOPRINT GROU GTOS BASI BYPASS PROPERTY ENTER 1 Table A.2 – Exemple de fichier intinp dans le cas de l’interaction de l’ion formate avec le cation calcium.
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AVERTISSEMENT Ce document est le fr
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ÉCOLE DOCTORALE SESAMES SYNTHÈSES
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Table des matières 1 Champs de for
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Sommaire Chapitre 1 Champs de force
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molécule n’ont pas la même libe
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1.1. Champs de force additifs de pa
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1.1. Champs de force additifs de pa
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1.2. La polarisation explicite est-
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1.3. Problématique et objectifs 15
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18 Chapitre 2. Énergies intermolé
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Chapitre 3 Développement d’un po
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3.1. Référence quantique utilisé
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3.2. Électrostatique 41 3.1.3 SAPT
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3.2. Électrostatique 43 La procéd
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Page 128 and 129: 120 Bibliographie 62. Jungwirth, P.
Page 130 and 131: 122 Bibliographie 87. De Courcy, B.
Page 132 and 133: 124 Bibliographie 110. Agre, P. et
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Page 136 and 137: 128 Bibliographie 160. Murdachaew,
Page 138 and 139: 130 Bibliographie 184. Karim, O. A.
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Page 142 and 143: 134 Bibliographie 231. Hermida-Ram
Page 144 and 145: 136 Bibliographie 254. Sefcik, J.,
Page 146 and 147: 138 Bibliographie 277. Darden, T.,
Page 148 and 149: 140 Bibliographie 300. Chen, W. et
Page 150 and 151: 142 Bibliographie 322. Chipot, C.,
Page 153: Vers une modélisation plus réalis
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