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Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le jury de ...

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Chapitre 3. Développement d’un potentiel intermoléculaire polarisab<strong>le</strong><br />

simp<strong>le</strong> et précis<br />

permettant d’améliorer la représentation au travers <strong>de</strong> multipô<strong>le</strong>s d’ordre plus é<strong>le</strong>vé<br />

tel<strong>le</strong>s que AMOEBA [48, 84], SIBFA [121] ou <strong>le</strong> modè<strong>le</strong> <strong>de</strong> la molécu<strong>le</strong> d’eau <strong>de</strong> Millot<br />

et Stone [228]. Une troncation à un ordre plus é<strong>le</strong>vé que <strong>de</strong> simp<strong>le</strong>s charges peut, <strong>par</strong><br />

exemp<strong>le</strong>, être motivée <strong>par</strong> l’importance du moment quadrupolaire, comme pour <strong>le</strong>s<br />

atomes <strong>de</strong> soufre ou d’oxygène [228]. Il <strong>est</strong> éga<strong>le</strong>ment possib<strong>le</strong> <strong>de</strong> prendre en compte <strong>de</strong>s<br />

effets d’ordre supérieur dans <strong>le</strong> potentiel d’interaction é<strong>le</strong>ctrostatique. En <strong>par</strong>ticulier,<br />

à courte distance, <strong>le</strong>s effets <strong>de</strong> pénétration é<strong>le</strong>ctroniques sont présents. Il existe <strong>de</strong>s<br />

fonctions pour reproduire ces effets, comme cela a été décrit <strong>par</strong> Stone [9] ou Freitag et<br />

al. [301]. Pour cela, l’introduction <strong>de</strong> gaussiennes en lieu et place <strong>de</strong> charges ponctuel<strong>le</strong>s<br />

<strong>est</strong> envisageab<strong>le</strong> [223, 262–265].<br />

L’ajout <strong>de</strong> multipô<strong>le</strong>s, <strong>de</strong> potentiels à courte distance et la modification <strong>de</strong> l’interaction<br />

é<strong>le</strong>ctrostatique peuvent être envisagés pour obtenir un potentiel é<strong>le</strong>ctrostatique plus<br />

précis. En contre<strong>par</strong>tie, dans un souci <strong>de</strong> simplicité du modè<strong>le</strong>, <strong>le</strong> choix <strong>de</strong> charges<br />

ponctuel<strong>le</strong>s sur <strong>de</strong>s sites atomiques <strong>est</strong> défendab<strong>le</strong>. Il existe diverses métho<strong>de</strong>s [28,<br />

302, 303] pour dériver <strong>le</strong>s charges et il a souvent été montré que l’emploi <strong>de</strong> simp<strong>le</strong>s<br />

charges suffisait à décrire <strong>le</strong> potentiel é<strong>le</strong>ctrostatique <strong>de</strong> la molécu<strong>le</strong> isolée. Dans <strong>le</strong> cas<br />

d’interactions <strong>de</strong> molécu<strong>le</strong>s, plusieurs artic<strong>le</strong>s [30, 163, 304, 305] indiquent qu’un potentiel<br />

utilisant uniquement <strong>de</strong>s charges suffit pour reproduire <strong>le</strong> potentiel intermoléculaire. <strong>Ce</strong>ci<br />

<strong>est</strong> aussi l’approche utilisée <strong>par</strong> <strong>le</strong> champ <strong>de</strong> force Amber [18] dans laquel<strong>le</strong> <strong>le</strong> potentiel<br />

é<strong>le</strong>ctrostatique <strong>est</strong> « l’empreinte génétique » <strong>de</strong> la molécu<strong>le</strong>.<br />

La dérivation <strong>de</strong> charges atomiques à <strong>par</strong>tir <strong>de</strong> la mécanique quantique peut se faire<br />

grâce à plusieurs métho<strong>de</strong>s. En <strong>par</strong>ticulier, citons <strong>le</strong>s métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong> Mulliken [29] et la<br />

métho<strong>de</strong> resp [18, 30, 31, 306]... <strong>Ce</strong>s métho<strong>de</strong>s sont directement accessib<strong>le</strong>s dans certains<br />

programmes <strong>de</strong> chimie quantique comme Gaussian [307] ou Gamess [308]. À Nancy, une<br />

métho<strong>de</strong> développée <strong>de</strong>puis 1993 [28, 32, 178, 179] permet <strong>de</strong> déterminer <strong>de</strong>s multipô<strong>le</strong>s<br />

sur une gril<strong>le</strong> <strong>de</strong> points. Un <strong>de</strong>s avantages <strong>est</strong> la non r<strong>est</strong>riction à un modè<strong>le</strong> <strong>de</strong> charges<br />

ponctuel<strong>le</strong>s, ce qui permet <strong>de</strong> com<strong>par</strong>er la reproduction du potentiel é<strong>le</strong>ctrostatique donné<br />

<strong>par</strong> un simp<strong>le</strong> modè<strong>le</strong> <strong>de</strong> charges ponctuel<strong>le</strong>s avec un modè<strong>le</strong> plus comp<strong>le</strong>xe (jusqu’à<br />

l’hexadécapô<strong>le</strong>). <strong>Ce</strong>tte approche <strong>est</strong> disponib<strong>le</strong> dans <strong>le</strong> logiciel Opep [33] qui reprend<br />

l’approche <strong>de</strong>s DMA (« distributed multipo<strong>le</strong> analysis ») introduite <strong>par</strong> Stone [190] à <strong>par</strong>tir<br />

du potentiel é<strong>le</strong>ctrostatique. Dans la suite <strong>de</strong> cette thèse, nous utiliserons la métho<strong>de</strong><br />

disponib<strong>le</strong> dans Opep pour obtenir <strong>le</strong>s multipô<strong>le</strong>s.

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