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th`ese de doctorat - Neurosciences Cognitives & Imagerie Cérébrale ...

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2.3. Recalage non-linéaire du cortex cérébralne sont pas critiques pour <strong>de</strong>s analyses reposant sur un nombre important <strong>de</strong> sujets, ellerestent déterminantes quand l'objectif est le diagnostic individuel puisqu'un alignementincorrect peut aboutir à une mauvaise classication <strong>de</strong> cet individu [65, 141].Fig. 2.5 Sous-groupe <strong>de</strong> 5 sujets parmi 20, alignés avec une approche linéaire (gauche)et la métho<strong>de</strong> non-linéaire DARTEL [9] (droite). Le sillon central est en rouge, le précentralen bleu, et le post-central en vert. Comme DARTEL n'intègre pas d'informationsanatomiques explicites, il ne peut pas empêcher l'alignement non spécique <strong>de</strong>s sillons : unepartie du sillon central d'un sujet est recalé sur le sillon post-central <strong>de</strong>s autres individus.Ainsi, les primitives sulcales explicites ont été expérimentées, aussi bien dans les approchessurfaciques [133, 119, 153, 156, 166] que volumiques [33, 78, 40, 143, 29]. Joshiet al. ont proposé <strong>de</strong> combiner une déformation surfacique guidée par les sillons avecune secon<strong>de</strong> étape <strong>de</strong> recalage volumique [85]. Cependant, dans toutes ces approches lasimilarité entre primitives sulcales repose sur leur paramétrisation, ce qui impose <strong>de</strong>s hypothèsesfortes sur leur topologie et donc sur leur segmentation. Quelques sillons sont alorsextraits manuellement, ce qui aboutit à une distribution éparse et hétérogène <strong>de</strong>s primitivesanatomiques guidant la transformation. L'hétérogénéité <strong>de</strong>s contraintes favorise lesirrégularités <strong>de</strong>s champs <strong>de</strong> déformations et peut aboutir à <strong>de</strong>s altérations <strong>de</strong> la topologiedu cortex. La métho<strong>de</strong> publiée dans [29] combine l'information d'intensité <strong>de</strong>s voxels avecla contrainte explicite <strong>de</strong> nombreux sillons i<strong>de</strong>ntiés automatiquement (cet étiquetage estprésenté dans la section 4.1 p.84). Cependant, le réglage <strong>de</strong> la pondération entre les primitivessulcales et iconiques n'est pas détaillé et la distribution <strong>de</strong>s contraintes entre lesdiérents sillons est empirique. Le problème <strong>de</strong> la robustesse aux erreurs d'étiquetage estabordé brièvement mais l'évaluation ne repose que sur 5 sujets dont les sillons ont étécorrigés manuellement. De plus, cette métho<strong>de</strong> est présentée comme un recalage apparié,c'est-à-dire d'un sujet sur un autre, ce qui induit un biais conséquent quant au choixdu sujet <strong>de</strong> référence étant donnée l'énorme variabilité interindividuelle <strong>de</strong> l'arborescence73

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