th`ese de doctorat - Neurosciences Cognitives & Imagerie Cérébrale ...

Chapitre 4Extraction de l'empreinte sulcaleindividuelleNous décrivons ici l'extraction automatique de l'empreinte sulcale à partir d'une IRMpondérée en T 1 . Cette étape cruciale va conditionner l'intérêt de notre approche, puisquesa cohérence repose sur la valeur anatomique des primitives sulcales. L'objectif ici estd'obtenir une représentation à la fois détaillée et reproductible de l'arborescence sulcale.Dans l'optique du recalage interindividuel, les primitives sulcales doivent concentrer unmaximum d'informations en un minimum de points, an de réduire le temps de calcul. Ils'agit donc de transformer l'information bas niveau des intensités des voxels en informationhaut niveau intégrant des a priori anatomiques qui sont introduits au cours desdiérentes étapes de la procédure d'extraction, comme illustré sur le schéma 4.1.Le procédé débute par la segmentation et l'identication automatique des sillons avecla méthode implémentée dans le logiciel BrainVISA (http ://brainvisa.info) [102]. Aveccet outil, la totalité des plis corticaux sont représentés sous la forme d'ensembles devoxels qui sont ensuite étiquetés en accord avec une nomenclature composée de 60 étiquettesdiérentes par hémisphère. Nous obtenons ainsi une description très détaillée del'arborescence sulcale intégrant tous les plis secondaires et tertiaires les plus variables.Nous proposons ensuite une procédure originale pour simplier automatiquement ces ensemblescomplexes de voxels sulcaux en primitives géométriques permettant de guider latransformation diéomorphique de tout le volume.83