2005/2006 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2005/2006Uppsala tekniska högskolaCivilingenjörsprogrammenKursplanerDynamiska Biologiska Nätverk, 5 poängDynamical Biological Networks1MB606Kursplanen är fastställd 2004-04-30 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämndenKursens placering i utbildningsprogramKursen ges inom Civilingenjörsprogrammen Molekylär bioteknik och BioinformatikStudieperiod: Kursen ges i period 44Mål för utbildningenMålet med denna kurs är att skapa en grundläggande förståelse för dynamiska modeller avadaptiva evolverande biologiska nätverk t.ex. neuronnät, immunnätverk, gennätverk,metaboliska nätverk och ekologiska system.Kursens innehållDeterministiska och stokastiska dynamiska modeller av dynamiska biologiska nätverk somneuronnät, gennätverk, metabola nät, och ekologiska system. Grundläggande begrepp somtidsskalor, adaptation, lärande, evolution, kortids- och långtidsminne, interna representationer,associativa minnen, generalisering, mönsterkomplettering, mönsterigenkänning. Algoritmer ochmetoder för att anpassa dynamiska nätverksmodeller till experimentella data och för att medhjälp av experimentella observationer kunna klassificera nätverk i olika grupper.Särskild behörighetLinjär algebra. Flerdimensionell analys. Matematisk statistik. Beräkningsvetenskap I. Lärandesystem för molekylär dataanalys.Undervisningsform: Föreläsningar, seminarier och laborationer.Examinationsform: Skriftlig tentamen vid kursens slut, inlämningsuppgifter. I kursen ingåendeövningar och laborationer som är poängsatta med 2 poäng.Betyg: Något av betygen, underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4) och medberöm godkänd (5).Övriga föreskrifterOmtentamen i betygshöjande syfte kan ej ske efter att sammanfattningsbetyg på kursen satts.Kurslitteratur(Prel)Bower, J.M and Bolouri, H., Computational Modeling of Genetic and BiochemicalNetworks. MIT Press, 2001.Utdrag ur textböcker och artiklar.Nivå: Kursen ges på D-nivåÄmne: Kursen ges inom huvudämnet Biologi. Kursen ges inom huvudämnet DatavetenskapKursen ges inom huvudämnet Teknik.Kursansvarig institution: Institutionen för teknikvetenskaper162