2005/2006 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2005/2006Uppsala tekniska högskolaCivilingenjörsprogrammenKursplanerSannolikhetslära och stokastiska processer, 4 poängProbability Theory and Stochastic Processes1MS704Kursplanen är fastställd 2002-04-24 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämnden och senastreviderad 2003-05-16 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämndenKursens placering i utbildningsprogramKursen ges inom Civilingenjörsprogrammet i bioinformatikStudieperiod : Kursen ges i period 24Mål för utbildningenAtt ge förtrogenhet med sannolikhetsteoretiska begrepp och en introduktion till teorin förstokastiska processer, särskilt Markovprocesser, och att ge en grund för att använda stokastiskamodeller inom bioteknik och bioinformatik.Kursens innehållSlumpvandring, Markovkedjor i diskret tid. Poissonprocessen, intensitetsbegreppet,Markovkedjor i kontinuerlig tid, födelse-dödsprocesser. Stationära fördelningar, jämvikt,extinktionstid. Tillämpningar från populationsdynamik såsom sannolikhet för nedärvd genetisklikhet, Wright-Fisher modellen, genetisk drift. Bioinformatiska tillämpningar såsom stokastiskametoder för sekvensanalys, avstånd i genetiska träd, mm.Särskild behörighetMatematisk statistik.UndervisningsformFöreläsningar och lektioner.ExaminationsformSkriftligt prov vid kursens slut. Obligatoriska uppgifter kan förekomma under kursens gång.Betyg : Något av betygen underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), mycketväl godkänd (5).KurslitteraturI. Kaj, Stochastic modeling for engineering studies. Kompendium, matematiska institutionen,2003.Material och exempel från G.R. Grant och W.J. Ewens: Statistical Methods in Bioinformatics:An Introduction. Springer, New York, 2001.ochD.L.Hartl och A.G.Clark: Principles of Population Genetics. 3rd Ed. Sinauer Associates, Inc.Sunderland, 1997.Nivå : Kursen ges på AB-nivåÄmne : Kursen ges inom huvudämnet MatematikKursansvarig institutionMatematiska institutionen427