12.07.2015 Views

2005/2006 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

2005/2006 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

2005/2006 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK <strong>2005</strong>/<strong>2006</strong><strong>Uppsala</strong> tekniska högskolaCivilingenjörsprogrammenKursplanerModellering av molekylära reglersystem, 5 poängModeling of molecular control systems1MB342Kursplanen är fastställd 2004-04-30 av teknisk- <strong>naturvetenskapliga</strong> fakultetsnämndenKursens placering i utbildningsprogramKursen ges inom Civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknikStudieperiod: Kursen ges i period X 43Mål för utbildningenKursen skall ge kunskap om kvantitativa aspekter av biologiska kontrollsystem för genuttryck,DNA-replikation och metabolism. Kursen skall vidare ge kunskap om matematiska, stokastiskaoch numeriska metoder för analys av dynamiskt beteende hos biologiska kontrollsystem.Kursens innehållIcke-linjär analys: Fasrumsanalys, bifurkationsteori, stabilitet, oscillationer. Mesoskopiskkinetik: Masterekvationen, Gillespie algoritmen, Linear noise approximationen. Reaktionsdiffusionsmodeller. Plasmidkopietals reglering. Principer bakom robusta kontrollsystem förKemotaxi och Morfogenes. Global analys av växande system. Biologiska kontrollsystem förreglering av genuttryck, repressorsystem och transkriptionell attenuering. Separation avtidsskalor. Flödesbalansanalys (FBA). I kursen ingår programmeringsinlämingsuppgifter iMATLAB. Dessa behandlar några utvalda kontrollsystem som illusterar känslighetsförstärking itranskriptionsreglering, skillanden mellan stokastisk och deterministisk analys av cirkadiskarytmer och robusthet i ryggformeringen hos bananflugan.Särskild behörighetReglerteknik. Genfunktion. Makromolekylära maskiner. Ordinära differentialekvationer.Beräkningsvetenskap I. Biofysikalisk kemi.UndervisningsformFöreläsningar och inlämninguppgifter.ExaminationsformSkriftligt prov vid kursens slut.BetygNågot av betygen underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4) eller med berömgodkänd (5)Övriga föreskrifterOmtentamen i betygshöjande syfte kan ej ske efter det att sammanfattningsbetyget på kursensatts.KurslitteraturEhrenberg M., Elf J. och Paulsson J.: Molecular system theory, kompendium.Nivå: Kursen ges på D-nivåÄmne: Kursen ges inom huvudämnet BiologiKursen ges inom huvudämnet TeknikKursansvarig institution Institutionen för biologisk grundutbildning348

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!