View - JUWEL - Forschungszentrum Jülich

Anhang
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A.3.2
Reduktion von 2,5-DKG zu 2-KLG im EMR
// Reduktion von 2,5DKG im EMR, with cofactor NADPH, and cofactor regeneration
by isopropanol und Lb-ADH
//unkompetitive Hemmung durch 2-KLG auf Lb-ADH
// cDKG = Konzentration von 2,5-DKG [mM]
// cKLG = Konzentration von 2-KLG [mM]
// cNADPH = Konzentration von NADPH [mM]
// cNADP = Konzentration von NADP [mM]
// t = Zeit [min]
// v = Reaktionsgeschwindigkeit [U/mg]
// red = Konzentration von Reduktase [mg Enzym / ml]
// KmDKG = Michaelis-Menten-Konstante für 2,5-DKG [mM]
// KmNADPH= MichaelisMentenKonstante für NADPH [mM]
// Kinadp = Inhibierungskonstante für NADP [mM]
// Kidkg = Substratüberschußinhibierungskonstante für 2,5-DKG [mM]
// vmax = Maximalgeschwindigkeit in U/mg
//cADH = Konz der ADH [mg/ml]
// Variables and parameters
IndVars: t
DepVars: cDKG, cKLG, cAce, cIso, cNADPH, cNADP, v1, v4, v3, umsatz
Params: vmax1, kmDKG, kidkg, kmNADPH, kinadp, vmax3, km31, kp31, ks31, km32,
kp32, vmax4, km41, kp4, km42, kp42, kiklg
//Kinetic equations
//v2 entfällt, da Reduktion von 2,5-DKG nicht reversibel
v1=red*vmax1*cDKG*cNADPH/
((kmDKG+cDKG*(1+(cdkg/kidkg)))*(kmNADPH*(1+cNADP/kinadp)+cNADPH))
v3=vmax3*cAce*cNADPH*cADH/
((km31*(1+cIso/kp31)+((1+(cKLG/kiklg))*cAce*(1+cAce/ks31)))*(km32*(1+cNADP/
kp32)+cNADPH))
v4=vmax4*cIso*cNADP*cADH/ (((km41*(1+cAce/kp41))+
((1+(cKLG/kiklg))*cIso))*(km42*(1+cNADPH/kp42)+cNADP))
//Mass balance equations
cDKG'=(28-cDKG)/tau-v1
cKLG'=(0-cKLG)/tau+v1
cAce'=(0-cAce)/tau-v3+v4
cIso'=(1000-cIso)/tau+v3-v4
cNADPH'=-v1-v3+v4
cNADP'=v1+v3-v4
umsatz=cKLG/(cDKG+cKLG)*100
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