Mechanische Anisotropie von Proteinen in ...

18 2. Mechanische Strukturbestimmung an einzelnen Proteinmolekülen
Abbildung 2.5: Intramolekulare Abstände (farbige Linien) d 132,212 , d 3,132 und d 3,212 sowie die
daraus resultierenden Positionen der Aminosäuren 3, 132 und 212 in der gefalteten GFP Struktur,
ermittelt in Einzelmolekülexperimenten. Schwarze Kreise zeigen den absoluten Messfehler an. Die
Graphik wurde mit der GFP Kristallstruktur 1EMB [15][8] ebenenparallel hinterlegt.
da die Indizes der Aminosäuren, über die Kraft an die noch verbleibende, feste Struktur
angelegt wird, nicht mit den Indizes der vermeintlich aufgegriffenen Aminosäuren i, j
übereinstimmen. Dieser Fall kann ebenfalls am GFP beobachtet werden. In Vorarbeiten
[29][32][74] wurden Fusionspolyproteine analysiert, in denen jeweils ein einzelnes GFP Molekül
über den N- und C-Terminus (Aminosäuren 1, 229) kovalent eingebunden war. Abb.
2.6 zeigt die Verteilung des Längenzuwachses der durch das dominante Entfaltungsereignis
N-C terminal belasteter GFP-Moleküle erzeugt wird 2 . Pro Einzelmolekülkraftkurve konnte
aufgrund der Konstruktion der Fusionsproteine jeweils nur ein GFP Entfaltungsereignis
beobachtet werden. Eine Vormittelung des Längenzuwachses pro Entfaltungsereignis wie
oben vorgestellt ist daher nicht möglich. Das Histogramm in Abb. 2.6 a) ist daher entsprechend
breiter als die vorgemittelten Histogramme in Abb. 2.4 a). Vergleicht man wieder
die Differenz aus maximal möglicher Länge L 1,229 eines vollständig entfaltenden GFP
2 Siehe Abb.1.5 für typische Kraftkurven.