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136 Chapitre 4. Implémentation du modèle Les structures corticales déterminant le cercle polaire étant identifiées automatiquement par Anatomist, la problématique est essentiellement de reconnaitre le pôle lui-même. Ici, il ne correspond pas à un point, mais à une zone entière du maillage, correspondant à une partie du corps calleux, et étant délimitée par l’indiseum griseum, résidu de l’hippocampe ventral. En réalité, une partie de la limite du pôle est identifiée par Anatomist, sur la partie dorsale de ce que nous appellerons ici le corps calleux, et étant nommé Sillon Calleux. Fig. 4.25 – Volume d’origine englobant la zone du pole cingulaire en rouge, représenté sur un cerveau. La segmentation du pôle cingulaire a été effectuée grâce à la définition d’un volume englobant le pôle cingulaire, sur plusieurs maillages de cerveaux faisant partie de la base de donnée ICBM, tous normalisés par-rapport au template ICBM-152, pour chaque hémisphère. Cette opération a permis d’obtenir un template volumique du pôle cingulaire, normalisé ICBM (exemple sur la figure 4.25). La matrice de transformation entre le template ICBM-152 et le repère de Talairach utilisée dans Anatomist est connue, et est utilisée afin de transformer le template du pôle cingulaire dans l’espace ICBM 152 vers l’espace de Talairach. Un template du pôle cingulaire normalisé dans l’espace de Brainvisa en résulte. D’un autre côté, chaque sujet est normalisé dans l’espace de Talairach par défaut par Brainvisa, lors des étapes de traitement des images IRM brutes. De ces étapes et de ce recalage est extrait la matrice de transformation Sujet-Talairach, propre à chaque sujet. L’utilisation de la matrice de transformation inverse
4.4. Algorithmes et méthodes utilisés 137 Fig. 4.26 – Haut : maillage de la surface corticale avec le volume du pôle cingulaire recalé dans le même référentiel que le sujet. Bas : Texture résultante de la fusion du volume template avec le maillage.
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UNIVERSITÉ DE LA MEDITERRANÉE U.F
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Remerciements L’aventure de ma th
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Introduction La compréhension du c
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Première partie Contexte Général
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