TH`ESE Cédric CLOUCHOUX LOCALISATION ET ...

5.2. Parcellisation du cortex 153
de sillons. Par cette méthode de représentation, basée sur des unités atomiques
du cortex profond, nous nous affranchissons du niveau de description des sillons.
5.2 Parcellisation du cortex
La parcellisation en gyri est étroitement liée aux études de morphométrie,
caractérisant des structures ou des régions par populations de sujets. Les
avancées récentes des méthodes automatiques de morphométrie cérébrale
ont connu un grand intérêt de la part de la communauté des neurosciences
[Ashburner and Friston, 2000, Fischl et al., 1999c, Thompson et al., 2000,
Flandin et al., 2002, Kochunov et al., 2005, Duchesnay et al., 2007]. Les outils
proposés fournissent de nouveaux moyens afin d’étudier la corrélation morphologie/fonction,
et ce selon différents paramètres, tels le sexe, la latéralité, les
caractéristiques génétiques ou encore la pathologie. Lors de ces études, il est
nécessaire de segmenter certaines structures afin de pouvoir les comparer.
Les techniques de segmentation des structures corticales s’intéressent souvent
à l’extraction des sillons [Bajcsy and Broit, 1982, Thompson et al., 2000,
Collins et al., 1998, Vailland and Davatzikos, 1999, Mangin et al., 2004a,
Rivière et al., 2002]. Les méthodes de parcellisation en gyri, malgré leur
potentielle utilité, ne sont pas utilisées courament dans la communauté de
neuro-imagerie. L’une des principales raisons est la difficultée et la complexité
d’un tel étiquetage manuel. Depuis quelques années, quelques méthode automatiques
sont apparues, et permettent une utilisation plus aisée des gyri
[Cachia et al., 2003, Fischl et al., 2004].
Etat de l’art
L’une des principales difficultés dans l’extraction automatique des gyri
réside dans le fait qu’aucune nomenclature universelle n’existe pour nommer ces
régions. En réalité, la définition même d’un gyrus est sujette à de nombreuses
discussion [Mangin et al., 1995, Thompson et al., 1996b, Fischl et al., 2004,
Cachia et al., 2003, Lohmann, 1998, Le Goualher et al., 1999]. Plusieurs
méthodes ont été proposées afin de segmenter efficacement l’ensemble du
cortex, afin d’effectuer des études de groupes, notament de morphométrie.
Cela signifie attribuer un nom neuro-anatomique à toutes les parties du
cortex, et plus uniquement à certaines structures, représentant un ensemble
discret de propriétés corticales [Rademacher et al., 1992, Paus et al., 1996,
Caviness et al., 1996, Lohmann and Von Cramon, 1999].
Afin de rester dans le cadre d’une représentation structurée de l’anatomie
corticale, en plus de la localisation pure et simple des éléments désirés, qu’il
s’agisse de sillons ou de gyri, la notion de relations de voisinnage est primordial.