TH`ESE Cédric CLOUCHOUX LOCALISATION ET ...

More documents

Recommendations

Info

154 Chapitre 5. Parcellisation corticale Pouvoir donner une signification anatomo-fonctionnelle aux structures extraites implique également pouvoir se baser sur leur organisation globale et relative, afin de modéliser un schéma de connectivité générique. L’introduction d’information anatomique a priori est essentielle dans le processus de parcellisation du cortex. Pouvoir introduire des données autres que l’information géométrique rend possible l’accès à une parcellisation prenant en compte des éléments tels que la cytoarchitectonie ou encore les relations connues entre l’anatomie et la fonction. Méthodes basées sur un atlas Tout comme la segmentation d’autres structures corticales comme les sillons, un atlas segmenté par un expert peut être utilisé, afin d’introduire de l’information a priori. La méthode poposée dans [Fischl et al., 2004] utilise le système de coordonnées surfaciques présenté dans [Fischl et al., 1999b] afin de stocker des informations statistiques a priori quand à l’appartenance d’un point du maillage à un certain gyrus. Une base de données, manuellement segmentée, est utilisée comme donnée d’entrainement au système, donnant la possibilité de parcelliser automatiquement des données selon différentes conventions neuro-anatomiques. Un tel système permet en outre d’incorporer des connaissances anatomiques expertes dans des zones où la géométrie locale ne suffit pas à déterminer une parcellisation correcte. L’utilisation des Champs de Markov aléatoires anisotropiques capture les relations spatiales et sépare les informations de différents types. Par exemple, cela permet d’encoder de l’information de type : “le gyrus precentral est souvent voisin du sillon central dans la direction de plus grande courbure (le long du sillon), mais pas dans la direction de faible courbure”. Le résultat de cette méthode est illustré sur la figure 5.2. Le résultat de la parcellation dépend de la nomenclature et du template utilisé. Dans [Fischl et al., 1999b], deux types de nomenclatures sont ainsi testées : SB (Surface-Based) et CMA (Center for Morphometric Analysis). La nomenclature SB permet d’obtenir des relations de voisinnages relativement constantes, en partie car la description des gyri repose sur une description des relations spatiales du template. En revanche, une parcellisation de type CMA ne propose pas une telle constance. La constance des relations de voisinage n’est donc pas garantie par la méthode, mais celle-ci permet de garder une cohérence par-rapport au modèle utilisé. Méthodes utilisant les sillons corticaux Un autre exemple de méthode utilisé afin de labéliser l’ensemble de la surface corticale est proposé dans [Cachia et al., 2003]. Cette technique utilise les sillons corticaux automatiquement extraits, afin de définir les limites des gyri. L’approche générique proposée repose sur des paires de sillons définissant des frontières de gyri, projetés sur la surface corticale. La parcellation est ensuite calculée grâce à deux diagrammes de
5.2. Parcellisation du cortex 155 Fig. 5.1 – Vue latérale de cinq hémisphères gauches, parcellisées selon deux conventions différentes. La méthode a utilisé deux jeux de données étiquetées manuellement, et selon deux nomenclatures : CMA (Center for Morphometric Analysis) [Rademacher et al., 1992, Caviness et al., 1996], et SB (Surface-Based) [Destrieux et al., 1998]. les deux lignes supérieures présentent des gyri obtenus en se basant sur les techniques du CMA, et les deux lignes inférieures ceux obtenus selon le schéma de parcellisation “Surface-Based” [Fischl et al., 2004]. Fig. 5.2 – Résultats de la parcellisation automatique, selon la convention CMA (cadre de gauche) et la SB (cadre de droite). La méthode ne garantit pas la stabilité des relations de voisinnage (dû également à la convention utilisée). [Fischl et al., 2004]. Voronoi, calculés sur le maillage du cortex. Le premier définit la zone d’influence de chaque sillon. Les frontières entre les zones entre des régions obtenues servent
Page 1:
UNIVERSITÉ DE LA MEDITERRANÉE U.F
Page 5 and 6:
Remerciements L’aventure de ma th
Page 7 and 8:
Remerciements 3 contribué à me re
Page 9 and 10:
Table des matières Introduction 8
Page 11 and 12:
Table des matières 7 5 Parcellisat
Page 13 and 14:
Introduction La compréhension du c
Page 15 and 16:
Introduction 11 de l’organisation
Page 17:
Première partie Contexte Général
Page 20 and 21:
16 Chapitre 1. L’analyse de donn
Page 22 and 23:
Page 24 and 25:
Page 26 and 27:
Page 28 and 29:
Page 30 and 31:
Page 32 and 33:
Page 34 and 35:
Page 36 and 37:
Page 38 and 39:
Page 41 and 42:
Chapitre 2 L’analyse surfacique L
Page 43 and 44:
2.1. Le cortex en deux dimensions 3
Page 45 and 46:
2.1. Le cortex en deux dimensions 4
Page 47 and 48:
2.2. Mise en correspondance de surf
Page 49 and 50:
Page 51 and 52:
Page 53 and 54:
Page 55 and 56:
Page 57 and 58:
2.3. Atlas et nécessité d’un mo
Page 59 and 60:
Page 61 and 62:
Page 63 and 64:
Page 65 and 66:
Page 67 and 68:
Page 69 and 70:
Page 71 and 72:
Page 73 and 74:
Page 75 and 76:
Chapitre 3 Anatomie corticale L’
Page 77 and 78:
3.1. Variabilité des structures co
Page 79 and 80:
Page 81 and 82:
Page 83 and 84:
3.2. Vers un modèle structuré de
Page 85 and 86:
3.2. Vers un modèle structuré de
Page 87 and 88:
3.3. Les racines sulcales 83 Fig. 3
Page 89 and 90:
Page 91 and 92:
Page 93 and 94:
3.3. Les racines sulcales 89 Dans [
Page 95 and 96:
Page 97 and 98:
3.3. Les racines sulcales 93 entiè
Page 99 and 100:
3.4. Cartes corticales et corrélat
Page 101 and 102:
Page 103 and 104:
Page 105 and 106:
3.5. Conclusions 101 réseau appart
Page 107 and 108: 3.5. Conclusions 103 anatomiques d
Page 109: Troisième partie Méthode
Page 112 and 113: 108 Chapitre 4. Implémentation du
Page 156 and 157: 152 Chapitre 5. Parcellisation cort
Page 168 and 169: 164 Chapitre 6. Résultats et valid
Page 186 and 187: 182 Conclusions et perspectives du
Page 188 and 189: 184 Conclusions et perspectives
Page 190 and 191: 186 Bibliographie [Boling and Olivi
Page 192 and 193: 188 Bibliographie Methodological as
Page 194 and 195: 190 Bibliographie [Flandin et al.,
Page 196 and 197: 192 Bibliographie [Lambert, 1772] L
Page 198 and 199: 194 Bibliographie [Mountcastle, 195
Page 200 and 201: 196 Bibliographie [Rivière et al.,
Page 202 and 203: 198 Bibliographie [Tucker and Willi
show all

TH`ESE Cédric CLOUCHOUX LOCALISATION ET ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?