traitement d'images par modèles discrets sur ... - Olivier Lezoray

CHAPITRE 1
Introduction générale
If we knew what we were doing, it
wouldn’t be called research, would it
ALBERT EINSTEIN
APRÈS des études en Informatique à l’Université de Caen Basse-Normandie, j’ai débuté
mes activités de recherches en 1995 à Caen au GREYC (Groupe de Recherche
en Informatique, Image, Automatique et Instrumentation de Caen) dans le cadre du
DEA d’Intelligence Artificielle et Algorithmique, sous la direction de Hubert Cardot.
Après une année de service militaire, j’ai continué en thèse de 1996 à 2000 au sein du groupe VAI
(Vision et Analyse d’Images) du LUSAC (Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de
Cherbourg) sous la direction de Marinette Revenu du GREYC. Cette thèse était financée par la
ligue contre le cancer et s’est déroulée à Cherbourg en étroite collaboration avec le laboratoire
d’anatomie et de cytologie pathologiques de l’hôpital Pasteur de Cherbourg qui s’appelle désormais
le Centre Hospitalier Public du Cotentin. L’objectif visé de cette thèse était la conception
d’un système de vision par ordinateur pour la reconnaissance de cellules dans des images microscopiques
couleur de cytologie des séreuses. Cet objectif fût atteint et nous avons conçu un
prototype nommé ARCTIC (Aide à la Recherche en Cytologie par le Tri Informatique Cellulaire).
J’ai pu concevoir un schéma de traitement d’image approprié à la segmentation d’images
microscopiques, définir des attributs de couleur et de texture cellulaires et enfin catégoriser les
objets cellulaires à l’aide d’une architecture de réseaux de neurones optimisée.
Après une année d’ATER (1999 − 2000) au sein du département d’Informatique de l’Université
de Caen Basse-Normandie, j’ai été nommé Maître de Conférences en Informatique à
l’IUT Cherbourg Manche, Antenne de Saint-Lô, en Septembre 2000. Je suis resté rattaché à
mon laboratoire de thèse, le LUSAC. Ma nomination coïncidait avec l’ouverture d’un nouveau
département de l’IUT Cherbourg Manche, le département SRC (Services et Réseaux de Communication)
délocalisé sur le site universitaire de Saint-Lô. Dès mon arrivée, nous avons eu à
mettre en place la structure de ce nouveau département qui ouvrait avec seulement quatre titulaires.
Avec mes collègues de l’époque, nous avons donc mis en place ce nouveau département.
Ces premières années furent donc très prenantes car j’ai dû assurer la tâche de directeur des
études et monter de toutes pièces tous les cours en Informatique pour les premières années et
également m’occuper avec mes collègues d’énormément de tâches annexes afférentes à l’ouverture
d’un nouveau département d’IUT. Ce contexte de site délocalisé éloigné de mon laboratoire
de recherche fût un peu particulier, mais la qualité des infrastructures que j’ai pu trouver à Saint-
Lô m’a permis de continuer mes activités de recherche, même à distance.
A mon arrivée à Saint-Lô, je restais rattaché au LUSAC dans l’équipe Vision et Analyse
d’Images. Avec l’arrivée de nouveaux collègues Maîtres de Conférences sur le site de Saint-Lô,
nous avons pu mettre en place un groupe de recherche et l’obtention d’une salle dédiée à nos
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