Archeologické rozhledy 2006 - Archeologický ústav AV ČR

Archeologické rozhledy LVIII–2006 241Obr. 1. Y chromozomový vývojovýstrom zobrazující ty polymorfismy/haploskupiny, které je možno analyzovats použitím kitu Signet Y-SNPIdentification System.Fig. 1. Y chromosome tree showingthose polymorphisms/haplogroupsthat can be analysed using the SignetY-SNP Identification System kit.získány na místních transfúzních stanicích s informovaným souhlasem oslovených dárcůa posléze byly anonymizovány.DNA byla izolována z periferní krve modifikovanou metodou podle Millera (1988). Integrita DNAbyla ověřena pomocí agarózové elektroforézy. Analýza Y-chromozomových SNPs byla provedena metodoualelicky specifické hybridizace (ASH). Použitím kitu Signet Y-SNP Identification System (MarligenBiosciences, www.marligen.com) bylo možné otestovat až 42 bialelických polymorfismů včetně amelogeninovéholokusu pro ověření přítomnosti Y chromozomu, a detekovat tak až 39 haploskupin v YCC stromu(obr. 1). Vlastní detekce probíhala na principu LabMAP Luminex technologie (www.luminexcorp.com),kde jako pevné nosiče specifických sond slouží polystyrénové mikrosféry o průměru 5,6 µm.Vlastní postup detekce polymorfismů zahrnoval pět samostatných kroků: amplifikaci příslušných lokusůpomocí multiplex PCR, inkubaci s exonukleázou I, fluorescenční značení, hybridizaci s mikrosférami(resp. sondami imobilizovanými na jejich povrchu) a v neposlední řadě vlastní detekci. Analýza probíhalapodle pracovního protokolu dodaného společně s výše zmíněným kitem.Dosažené výsledky byly srovnány s výsledky celoevropské MSY diverzity (Semino et al. 2000). Jelikožvýše zmíněná studie byla publikována dva roky před ustanovením nové jednotící nomenklatury, bylonutné původní označení haploskupin (Eu1 – Eu22) převést na dnes všeobecně akceptovaný systém fylo-