Manual para la comercialización y producción de semillas - Inia

MANUAL PARA LA COMERCIALIZACIÓN Y PRODUCCIÓN DE SEMILLAS Y PLANTAS FORESTALES
• Codominancia. El análisis del marcador debe permitir detectar las dos copias del
locus presentes en cada muestra (heredadas cada una de uno de los progenitores).
No obstante, y como se verá más adelante, existen marcadores dominantes muy eficientes
y ampliamente utilizados.
• Distribución uniforme en el genoma. Los marcadores deben estar distribuidos por
todo el genoma, de modo que su análisis permita estimar de una manera más eficiente
la variabilidad existente entre las muestras estudiadas.
• Discriminantes. En virtud de esta propiedad, el marcador permite distinguir nítidamente
una muestra (o grupo de muestras) de otra.
Otras características deseables, más de índole práctica, son:
• Independientes del ambiente. La detección del marcador no debe verse influida por
las condiciones ambientales del experimento y de la propia muestra (salvo que se
utilice en estudios funcionales muy concretos, sobre el efecto de ese factor ambiental).
• Reproducibles entre laboratorios. Característica ligada con la anterior, permite la
comparación de resultados.
• Rapidez, facilidad y economía de análisis.
Tipos de marcadores moleculares 1
Marcadores proteicos
Existen dos técnicas básicas de utilización de las proteínas como marcadores moleculares.
El primero de ellos consiste en la electroforesis bidimensional a partir de un extracto
proteico. Se separan de este modo las proteínas en función de su punto isoeléctrico
y su tamaño, obteniéndose un “mapa” bidimensional de las proteínas presentes en el extracto.
Se trata de una técnica relativamente compleja; la interpretación de los resultados
y comparación de mapas es laboriosa, requiriendo el uso de analizadores de imagen y programas
informáticos específicos. Por tanto, no es una técnica muy utilizada en estudios de
diversidad en especies forestales ni es recomendable su utilización para la identificación
y verificación de material de reproducción.
El otro gran grupo de marcadores proteicos lo constituyen las isoenzimas. En estas
técnicas se evalúa en cada muestra la presencia de variantes (alelos) de un determinado enzima.
Se separan en un gel mediante electroforesis las proteínas de un extracto en función
de su tamaño. A continuación se lleva a cabo la tinción del gel, mediante la reacción catalizada
por el enzima en cuestión, detectándose las variantes que lleva cada muestra. Estos
marcadores tienen como ventajas el ser baratos y codominantes, lo que los hace adecuados,
por ejemplo, para análisis de paternidad. En cambio, como desventaja podemos
1
Para una descripción más detallada de todas estas técnicas puede consultarse a Jiménez y Collada
(2000).
278