SEIX 17-20 octobre 2005 - Atelier Calcium

ATELIER MODELISATION DE LA SIGNALISATION CALCIQUE
Jacques Haiech
Institut Gilbert Laustriat, IFR85 «Biomolécules et Innovations Thérapeutiques» UMR 7175
CNRS, Faculté de Pharmacie et Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg, 74, route
du Rhin, 67401 ILLKIRCH
Comprendre la signalisation calcique passe par une modélisation du signal calcium.
L‟objectif de cet atelier est d‟aborder les concepts et méthodes de cette modélisation, non pas
pour les dominer mais pour avoir l‟envie de les utiliser et de les comprendre.
Au delà de la description du signal calcium et des éléments qui le composent, le but est de
construire à minima un modèle prédictif et dans le meilleur cas un modèle explicatif.
On va d‟abord définir ce que l‟on entend par :
signal calcique et on en déduira différentes approches de modélisations,
modèle macroscopique versus modèle microscopique et on en déduira les limites
des modèles utilisés ou développés dans la littérature,
utilisation des modèles soit pour prédire (pharmacologie virtuelle par exemple) soit
pour comprendre (aide à la création et à l‟interprétation d‟expériences).
Les modélisations du signal calcique
Le signal calcique doit être vu comme :
un signal physique, à savoir la modification dans l‟espace, dans le temps et dans un
volume donné du nombre d‟atome de calcium. Cela nécessite un système capable
de réguler cette valeur physique et d‟un point de vue expérimental, des systèmes
d‟observations, qui interférent peu ou de manière quantifiable avec le système
précédent.
Un signal logique, à savoir le déchiffrage du signal physique et sa transformation
en un effet et/ou phénomène biologique (prolifération, motilité, métabolisme,
différentiation, …).
La modélisation du signal physique implique :
une définition des compartiments impliqués dans le signal,
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