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Research Report 2010 - MDC

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<strong>Research</strong> Projects 2008-2009Forschungsprojekte 2008-2009Collaborative research centres (SFB) und transregional research centres (TRR) ofthe German <strong>Research</strong> Foundation (DFG)SFB 449:Structure and function of membrane receptorsSFB 594:Molecular machines in protein folding and protein transportSFB 633:SFB 650:SFB 577:SFB 618:SFB 665:SFB 740:SFB 555:SFB Transregio 19:SFB Transregio 36:SFB Transregio 43:SFB Transregio 54:Induction and modulation of T cell-impartedImmunreactions in the gastrointestinal tractCellular approaches to the suppression of undesirableimmunroactionsMolecular principles of the clinical variability of monogenicdiseasesTheoretic biology: robustness, modularity and evolutionarydesign of living systemsDevelopment disorders in the nervous systemFrom molecules to modules: Organization and dynamics offunctional units in cellsComplex non-linear processesInflammatory cardiomyopathy – molecular pathogenesisand therapyPrinciples and applications of adoptive T cell therapyThe brain as a target of inflammatory processesGrowth and survival, plasticity und cellular interactivity oflymphatic neoplasiasSFB Transregio 52: Transcriptional programming of individual T-cell populationsSFB Transregio 3: Mesial temporal lobe epilepsiesSFB Transregio 3: Mesiale Temporallappen-EpilepsienSonderforschungsbereiche (SFB) und Transregios (TRR) der DeutschenForschungsgemeinschaft (DFG)SFB 449Struktur und Funktion membranständiger RezeptorenSFB 594SFB 633SFB 650SFB 577SFB 618SFB 665SFB 740SFB 555SFB Transregio 19SFB Transregio 36SFB Transregio 43SFB Transregio 54SFB Transregio 52SFB Transregio 3Molekulare Maschinen in Proteinfaltung undProteintransportInduktion und Modulation T-zellvermittelter Immunreaktionenim GastrointestinaltraktZelluläre Ansätze zur Suppression unerwünschterImmunreaktionenMolekulare Grundlagen klinischer Variabilität monogenbedingter KrankheitenTheor. Biologie: Robustheit, Modularität und evolutionäresDesign lebender SystemeEntwicklungsstörungen im NervensystemVon Molekülen zu Modulen: Organisation und Dynamikzellulärer FunktionseinheitenKomplexe nichtlineare ProzesseInflammatorische Kardiomyopathie – MolekularePathogenese und TherapieGrundlagen und Anwendung adoptiver T-ZelltherapieDas Gehirn als Angriffsziel inflammatorischer ProzesseWachstum und Überleben, Plastizität und zelluläreInteraktivität lymphatischer NeoplasienTranskriptionelle Programmierung individueller T-Zell-PopulationenMesiale Temporallappen-EpilepsienNational Genome <strong>Research</strong> Network (NGFN-2) ProjectsGenome network cardiovascular diseases: Comparative genomics of leftventricular hypertrophy and dysfunction in hypertensionGenome network cardiovascular diseases: Functional genomics of cardiacdamage in hypertensionGenome network cardiovascular diseases: Location Berlin <strong>MDC</strong>: Prevalenceof Titin-mutations and identification of new disease genes in patients withfamilial dilative cardiomyopathySystematic-methodical platform "DNA", location <strong>MDC</strong>, Berlin"Systematic-methodical platform "DNA": National genotyping platformSystematic-methodical platform GEM: Location Berlin "Genomwide correlationanalysis and association studies with 10K and 100K arrays"Genome network neuro: Systematic gene identification und functional analysisfor frequent neurologic diseasesGenome network neuro: Molecular genetic identification of activity scheduledgene configurations of genetically determined epilepsiesCancerNet: Organ Specificity of Colorectal Cancer MetastasisSystematic-methodical platform "Protein": Verification and identification ofprotein-protein interactions and systematic analysis of target proteins via X-ray structure analysis, TP 7 – Structure determinationSystematic-methodical platform "Protein": Verification and identification ofprotein-protein interactions and systematic analysis of target proteins via X-ray structure analysis, TP 20 – Project managementSystematic-methodical platform "Protein": Verification and identification ofprotein-protein interactions and systematic analysis of target proteins via X-ray structure analysis, TP 8 Yeast two-hybrid protein interaction networksSystematic-methodical platform "Protein", Location <strong>MDC</strong> Berlin: Verificationand identification of protein-protein interactions and systematic analysis oftarget proteins via X-ray structure analysis, TP 1.1. Subcloning of full-lengthORF's and cDNA-fragments into expression plasmidsDetermination of genes underlying Williams-Beuren Syndrom by generationof an allelic series of mutations with the aid of novel transposonapproaches, TP1Projekte im Nationalen Genomforschungsnetz (NGFN-2)Genomforschungsnetz Kardiovaskuläre Krankheiten: Vergleichende Genomicsder links-ventrikulären Hypertrophie and Dysfunktion bei BluthochdruckGenomforschungsnetz Kardiovaskuläre Krankheiten: Funktionelle Genomicsder Herzschädigung bei BluthochdruckGenomforschungsnetz Kardiovaskuläre Krankheiten: Standort Berlin <strong>MDC</strong>:Prävalenz von Titin-Mutationen und Identifizierung neuer Krankheitsgene inPatienten mit Familiärer Dilativer KardiomyopathieSystematisch-Methodische Plattform "DNA", Standort <strong>MDC</strong>, Berlin"Systematisch-Methodische Plattform "DNA": NationaleGenotypisierungsplattformSystematisch-methodische Plattform GEM: Standort Berlin "GenomweiteKopplungsanalyse und Assoziationsstudien mit den 10K und 100K Chips"Genomnetz Neuro: Systematische Genidentifikation und funktionelle Analysenbei häufigen neurologischen ErkrankungenGenomnetz Neuro: Molekulargenetische Identifizierung von disponierendenGenkonfigurationen bei genetisch determinierten EpilepsienCanerNet: Organspezifität von Darmkrebs MetastasierungSystematisch-Methodische Plattform "Protein": Vertifikation und Identifikationvon Protein-Protein Interaktionen und systematische Analyse vonTargetproteinen mittels Röntgenstrukturanalyse, TP 7 – Struktur- aufklärungSystematisch-Methodische Plattform "Protein": Vertifikation und Identifikationvon Protein-Protein Interaktionen und systematische Analyse vonTargetproteinen mittels Röntgenstrukturanalyse, TP 20 – Projekt- managementSystematisch-Methodische Plattform "Protein": Vertifikation und Identifikationvon Protein-Protein Interaktionen und systematische Analyse vonTargetproteinen mittels Röntgenstrukturanalyse, TP 8 Yeast two-hybrid ProteinInteraktionsnetzwerkSystematisch-Methodische Plattform "Protein", Standort <strong>MDC</strong> Berlin:Verifikation und Identifikation und systematische Analyse von Targetproteinenmittels Röntgenstrukturanalyse", TP 1.1. Umklonierung von full-length ORF'sund cDNA-Fragmenten in Expressions-PlasmideBestimmung der Gene, die dem Williams-Beuren Syndrom zugrundeliegendurch die Generation einer allelischen Serie von Mutationen mit Hilfe von neuartigenTransposon Ansätzen, TP1Overview 269

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