universita' degli studi della tuscia facolta' di agraria ... - Unitus DSpace

3.2 Marcatori biochimici
Un secondo livello di analisi corrisponde all’impiego di marcatori proteici; fra questi gli
isoenzimi ricoprono un ruolo importante. Gli isoenzimi sono forme diverse di un medesimo
enzima con la stessa specificità di substrato. Tale polimorfismo dipende da mutazioni che
hanno portato alla formazione di seri alleliche multiple allo stesso locus. Ciascuna forma
isoenzimatica può essere quindi collegata concettualmente ad un particolare allele. Le prime
esperienze di analisi del polimorfismo isoenzimatico in popolazioni naturali possono essere
fatte risalire a Lewontin e Hubby (1966) su Drosophila pseudoobscura. Da allora gli
isoenzimi sono stati molto utilizzati anche in ambito vegetale ed in partircolare per studi di
genetica delle popolazioni (Brown, 1979). I principali vantaggi di questi marcatori sono la
codominanza, la mancanza di effetti epistatici e pleiotropici, la relativa facilità d’impiego, i
bassi cosi di utilizzo, la riproducibilità delle analisi. Gli isoenzimi presentano però alcuni
importanti limiti. Innanzitutto, il numero di sistemi enzimatici polimorfici analizzabili è
piuttosto limitato (12-20). Questo rende difficoltose o impossibili le indagini in popolazioni
con un non elevato livello di polimorfismo. Inoltre, i loci enzimatici rappresentano solo una
piccola e non casuale parte de genoma (quella espressa). La variabilità osservata potrebbe
dunque non essere rappresentativa dell’intero genoma.
3.3 Marcatori molecolari
Lo studio della diversità genetica di specie selvatiche e coltivate attraverso marcatori
molecolari, rappresenta un innovativo sistema di indagine che ha molteplici applicazioni nel
miglioramento genetico. I marcatori molecolari sono stati, infatti, ampiamente utilizzati per la
caratterizzazione genotipica di diverse specie vegetali. Attualmente hanno trovato ampia
applicazione nell’accertamento dell’identità varietale, fondamentale soprattutto in specie a
propagazione vegetativa, e per risolvere casi di omonimia e sinonimia.
L’analisi del genoma mediante marcatori molecolari è in grado di rilevare la diversità,
espressa come mutazione, di regioni di DNA omologhe in individui appartenenti alla stessa
specie. Un marcatore molecolare può essere definito come quel locus genomico, rilevabile
con sonde (=probe) o inneschi (=primer) specifici che, in virtù della sua presenza,
contraddistingue in modo caratteristico ed inequivocabile il tratto cromosomico con il quale si
identifica e le regioni che lo circondano alle estremità 5’ e 3’ (Barcaccia et al. 2000). Tali
marcatori, di conseguenza, non sono generalmente riferibili all’attività di specifici geni, ma si
66