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asano direttamente sulla rilevazioni di differenze (=polimorfismi) nella sequenza
nucleotidica del DNA che costituisce il genoma di ogni individuo (dovute ad inserzioni,
delezioni, traslocazioni, duplicazioni, mutazioni puntiformi, ecc.)
I marcatori molecolari rappresentano, per la ricerca genetica, degli strumenti eccezionali,
poiché consentono di identificare specifiche sequenze nucleotidiche e quindi analizzare
polimorfismi di particolari geni o regioni cromosomiche. All’interno di una specie gli
individui si diversificano l’uno dall’altro per un numero più o meno elevato di caratteri
(loci)che assumono diverse forme (alleli) e ciò mette nella condizione di poter rilevare i
polimorfismi (mutazioni) nelle regioni di DNA omologhe (Loci).
Il termine di “fingerprinting” (impronta digitale), oggi comunemente impiegato come
sinonimo di identificazione varietale, è stato coniato inizialmente per indicare la
caratterizzazione molecolare, data l’elevata informatività e la precisa identificazione che
alcune di queste metodologie permettono.
Rispetto ad altri marcatori genetici, i marcatori molecolari presentano numerosi vantaggi, in
quanto:
- Il loro numero è virtualmente illimitato, permettendo di ottenere mappe genetiche sature e di
scandagliare approfonditamente la variabilità genetica nelle popolazioni naturali.
- Non sono influenzati dall’ambiente né, come nel caso degli isoenzimi, dal tessuto e dallo
stadio fenologico.
- Molti di essi sono in grado di rilevare differenze nelle sequenze nucleotidiche di regioni non
espresse, meno conservate evolutivamente, del genoma, quindi evidenziano un livello di
polimorfismo più elevato rispetto agli altri marcatori genetici.
- La codominanza di alcune categorie di marcatori (RFLP, STS) semplifica notevolmente
l’analisi genetica.
- Generalmente non sono associati a caratteristiche agronomiche e qualitative indesiderabili
- La possibilità di evidenziare in molti casi, polimorfismo genetico tra i genomi permette
l’analisi genetica anche in una situazione polipoide.
- Possono essere rilevati su tutti i tessuti della pianta ed indipendentemente dallo stadio di
sviluppo, semplificando ed accelerando l’analisi genetica e la selezione assistita (Tanksley,
1983).
Il numero di marcatori molecolari oggi a disposizione è molto numeroso ed è sempre in
aumento anche in conseguenza della continua nuova messa a punto di tecniche di analisi del
DNA. Spesso si identificano con sigle diverse marcatori molecolari che adottano tecniche
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