Hereditäre Tumorsyndrome des Kolons und Rektums

Probe
Patient
Normal Adenom Tumor Geschlecht Alter TNM Stadium
Sporadisch
1
2
3
4
5
6
7
CR107N
CR135N
CR139N
CR149N
CR164N
CR174N
CR211N
CR105P
CR133P
CR138P
CR150P
CR162P1, CR163P2
CR173P
CR210P
CR106T
CR134T
CR137T1, CR136T2
CR148T
CR161T
CR172T
CR209T
F
M
M
M
M
M
M
71
77
78
60
61
74
76
T3N0Mx
T4N1Mx
T4N1Mx
T3N0Mx
T3N0Mx
T3N1Mx
T3N1Mx
FAP
1
2
3
4
5
6
7
8
FAP1N
FAP2N
FAP3N
FAP5N
FAP6N
FAP7N
FAP8N
FAP9N
FAP1P
FAP2P1, FAP2P2
FAP3P1, FAP3P2
FAP5P1, FAP5P2, FAP5P3
FAP6P1, FAP6P2, FAP6P3
FAP7P
FAP8P
FAP9P
FAP8T1, FAP8T2
FAP9T
M
F
M
F
M
M
M
F
30
32
34
22
36
31
45
29
T3N0Mx, T3N0Mx
T3N0Mx
Tab.5: N: Normalmukosa, P: Polyp, T: Karzinom von insgesamt 15 Patienten (7x
sKRK, 8xFAP). Nummeriert wurden sie mit CR (Colorectum) sowie FAP, dann die
fortlaufende Probennummer und Entität (N, P, T, M). Des weiteren Geschlecht,
Alter und TNM-Klassifikation gemäß WHO Kriterien.
4.3.1. Quantitative Unterschiede innerhalb der verschiedenen Stadien der
FAP und des sporadischen Karzinoms
Hier sind nur die Proteinspots analysiert worden, die in allen Gelen des Matchsets
präsent waren. Die Densitätswerte jedes Proteinspots wurden in logarithmische
Form umgewandelt, berechnet und verglichen. Dieser logarithmisch berechnete
Densitätswert jedes Proteinspots für das jeweilige Stadium der Erkrankung wurde
durch Umformen in die False Discovery Rate (FDR) angepasst. Informationen zur
FDR wurden ausführlich von Benjamini et al beschrieben 127 . Proteine wurden als
eventuelle Markerkandidaten betrachtet, wenn sie eine FDR unter 10% aufwiesen.
In den sporadischen Gewebeproben sind 18 Proteine gefunden worden, die eine
FDR unter 10% hatten. Beim FAP Karzinom konnten zwei Proteine mit einer FDR
unter 10% nachgewiesen werden.
55