Von besonderem Interesse waren Proteine, die in sämtlichen Normalschleimhaut- FAP Proben vorhanden waren <strong>und</strong> in keinem der sporadischen Normalproben nachgewiesen wurden, sowie umgekehrt. Sie sind in Abb. 25 mit Pfeilen markiert. Um nun diejenigen Proteine zu definieren, die exklusiv in einer Gruppe von Normalgewebeproben (FAP vs. sKRK) vorhanden waren (potentielle Markerproteine), wurde das Vorhandensein bzw. nicht Vorhandensein eines jeden Proteins mittels Fischer`s Exact Test errechnet <strong>und</strong> in eine Tabellenform (Tab.6) gebracht. Hieraus ergab sich, dass 47 Proteine in der normalen Schleimhaut der FAP immer vorhanden waren <strong>und</strong> nie in der normalen Schleimhaut der sporadischen Proben detektiert wurden. Abbildung 26 zeigt den Boxplot der logarithmisierten Werte für die 47 Proteine, sortiert nach Mittelwert (MW). Protein MW Varkoef. Protein Mean Varkoef Protein Mean Varkoef 4564 8,14 0,05 7453 5,6 0,14 7443 4,79 0,19 4817 6,72 0,14 7558 5,39 0,14 3768 4,71 0,1 8634 6,57 0,11 3730 5,38 0,15 4815 4,68 0,28 1633 6,4 0,17 6562 5,36 0,15 2620 4,63 0,25 3879 6,37 0,13 4830 5,36 0,32 7325 4,32 0,2 3881 6,36 0,14 5829 5,29 0,19 5708 4,31 0,13 3854 6,29 0,18 9606 5,27 0,1 7612 4,14 0,2 3878 6,19 0,1 3736 5,23 0,1 7458 4,12 0,27 5832 6,15 0,13 8632 5,14 0,12 3322 4,02 0,25 8523 6,14 0,18 8625 5,1 0,08 6344 3,92 0,19 8627 5,88 0,12 8644 5,02 0,19 5448 3,9 0,31 6756 5,88 0,2 4827 4,96 0,16 5122 3,33 0,45 4725 5,79 0,14 4622 4,89 0,3 7158 3,32 0,37 4833 5,78 0,28 5529 4,89 0,16 8425 3,06 0,59 5630 5,62 0,13 3722 4,86 0,29 Tab.6: In der ersten Spalte findet sich die Proteinnummer (SSP Nummer), es folgt die durchschnittliche log. Densitätsmessung <strong>des</strong> spezifischen Proteins <strong>und</strong> der jeweilige Korrelationskoeffizient. Alle diese Proteine wurden exklusiv in der normalen Mukosa der FAP Proben definiert. 58
Abb. 26: Boxplot-Darstellung der 47 Proteine, die exklusiv in der Normalschleimhaut der FAP exprimiert wurden. Die Ordinate entspricht dem jeweils errechneten log. Mittelwert, auf der Abszisse ist die jeweilige Proteinnummer (SSP) aufgelistet (s. Tab. 6). 4.3.2.2. Polypen Die gleiche Untersuchung der Polypen beider Gruppen ist in der folgenden Abbildung dargestellt (Abb. 27). Wiederum verdeutlicht die Heatmap, dass die sporadischen Polypen von den FAP Polypen durch das Vorhandensein bzw. nicht Vorhandensein verschiedener Proteine voneinander unterschieden werden können (s. Markierung durch Pfeile Abb. 27). Bei den Polypenproben haben wir 49 Proteine detektiert, die ausschließlich in den FAP Proben exprimiert wurden <strong>und</strong> ein Protein, welches exklusiv in allen sporadischen Proben, jedoch nie bei FAP zu sehen war. Diese sind in Tabelle 7 mit ihren SSP Nummern gelistet. Abbildung 28 zeigt den Boxplot der Analyse FAP-Polyp vs. Polyp bei sKRK basierend auf den logarithmischen Proteindensitätsmessungen. Das blau markierte Protein ist das einzige spezifische Protein der sporadischen Proben. 59
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