Hereditäre Tumorsyndrome des Kolons und Rektums

3. Material und Methoden 32
3.1. Präparation und Asservierung der Proben 32
3.1.1. Franzén-Technik („Cell enrichment“) 32
3.2. Zweidimensionale Gelelektrophorese 34
3.2.1. Isoelektrische Fokussierung (1. Dimension) mit IPG Strips 35
3.2.2. SDS Polyacrylamid Gelelektrophorese (2.Dimension) 36
3.3. Computergestützte Bildanalyse 38
3.3.1. Detektion der Proteinspots im Gel 38
3.3.2. Matchset 39
3.3.3. Analyse des Matchsets 41
3.3.4. Statistische Analyse 42
3.4. Massenspektrometrische Identifikation 44
4. Ergebnisse 47
4.1. Histologie 47
4.2. Proteinexpression in der Genese und Progression des
sporadischen kolorektalen Karzinoms 47
4.2.1. Test der Probenheterogenität bei sporadischen
Tumoren und Metastasen 48
4.2.2. Principle Component Analyse (PCA) 49
4.2.3. Identifikation dysregulierter Proteine im Vergleich von
Mukosa und Polyp versus Karzinom und Metastase 51
4.3. Vergleich der Proteinexpression des sKRK zur FAP 54
4.3.1. Unterschiede innerhalb der verschiedenen Stadien
der FAP und des sporadischen Karzinoms 55
4.3.1.1. Quantitative Unterschiede im Vergleich
zwischen normaler Schleimhaut der
FAP und dem sporadischen Karzinom 56
4.3.2. Qualitative Unterschiede zwischen der FAP und
dem sporadischen Karzinom 57
4.3.2.1. Normale Schleimhaut 57
4.3.2.2. Polypen 59
6