TESI Dottorato FAVILLA MARA - Università degli Studi del Molise
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Tabella 2.2 Oligonucleotidi utilizzati per l’amplificazione <strong>del</strong> frammento <strong>del</strong> gene<br />
16S rRNA e per il successivo sequenziamento<br />
Primer<br />
P0<br />
P6<br />
P5<br />
we16s1r<br />
we16s1f<br />
we16s2r<br />
P16S-1541<br />
Posizione (a)<br />
27f<br />
1495r<br />
930f<br />
408r<br />
1061f<br />
1073r<br />
1541r<br />
57<br />
Sequenza<br />
5'- GAGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3'<br />
5'- CTACGGCTACCTTGTTACGA-3'<br />
5'-AAGGAATTGACGGGGGC-3'<br />
5'-AGCCGAAACCCTTCATCAC-3'<br />
5'-GACAGGTGGTGCATGGTTG-3'<br />
5'-AACCCAACATCTCACGACA-3'<br />
5’-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3’<br />
(a) La posizione corrisponde a quella sul gene 16S rRNA di E. coli, dove l’estremità<br />
3’ si allinea in direzione forward (f) o reverse (r).
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