Ataxie mit okulomotorischer Apraxie Typ 2: Charakterisierung des ...

Einleitung 6
und in die zelluläre Antwort auf oxidativen Stress involviert (29) . AOA2-Zellen haben
scheinbar einen Defekt bei der DNA-Reparatur, da sie sensitiv auf oxidierende Reagenzien
reagieren (29) . Sie zeigen jedoch keine erhöhte Sensitivität gegenüber ionisierender
Strahlung (30) . Steinmetz et al. 2006 zeigten, dass ein Aminosäureaustausch im Sen1p-
Protein die genomweite Verteilung der RNA-Polymerase II verändert, was darauf hinweist,
dass das Hefeprotein bei der Transkription eine Rolle spielt (31) . Im Jahr 2009
identifizierten Suraweera et al. Proteine, die mit dem Senataxin interagieren. Diese
Proteine einschließlich der RNA-Polymerase II sind in Mechanismen wie Transkription
und RNA-Prozessierung involviert. Weitere funktionelle Analysen zeigten, dass das
Senataxin ähnlich wie das Hefeprotein Sen1p eine wichtige Rolle bei verschiedenen
Regulationsmechanismen der Transkription spielt (32) . Das Senataxin scheint also neben
der Rolle bei der DNA-Reparatur eine vielseitige Funktion in der Genexpression zu
besitzen. Obwohl das Senataxin eine postulierte Helikasedomäne besitzt, wurde eine
solche Aktivität bisher nicht nachgewiesen.
2.5 Zielsetzung der Arbeit
Ziel dieser Arbeit ist es, neue Mutationen im SETX-Gen zu identifizieren, die die Ataxie
mit okulomotorischer Apraxie Typ 2 verursachen.
Für 79 DNA-Proben von Patienten mit klinischem Verdacht auf AOA2 werden die
kodierenden Exons und flankierende Intronsequenzen des SETX-Gens sequenziert. Bei
Vorliegen einer heterozygoten Veränderung oder dem Hinweis auf umfangreiche
Genveränderungen werden zusätzlich quantitative Analysen durchgeführt und die nicht
kodierenden Exons 1 und 2, sowie ~500 Basen des 5’-UTR-Bereiches sequenziert. Weiter
ist geplant den Effekt umfangreicher Genveränderungen anhand von RNA-Analysen zu
überprüfen.
Detektierte Sequenzveränderungen sollen dann charakterisiert und bezüglich ihrer
Pathogenität beurteilt werden. Hierfür sollen Familienanalysen, Haplotyp-Analysen sowie
Untersuchungen von Kontrollproben zur Einschätzung der Frequenz der Veränderungen
durchgeführt werden.