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Cancers végétal <strong>et</strong> animal<br />
horizontal <strong>de</strong> 1% contenant 1 µg ml -1 <strong>de</strong> bromure d'éthidium. La migration est réalisée dans<br />
un tampon TBE 1x par une électrophorèse horizontale à 80 V pendant 90 min. Le gel a été<br />
photographié sous UV (302 nm).<br />
3.4.1.4.4. Séquençage <strong>de</strong> l’ADN plasmidique (VIRB11 <strong>et</strong> VIR G15’)<br />
Le produit PCR est purifié en utilisant le Kit QIAquick PCR purification Kit (QIAGEN,<br />
Courtaboeuf, France). Le séquençage a été réalisé par un séquenceur automatique à<br />
capillaires, Megabace 1000 (Amersham Pharmacia Biotech Europe, Orsay, France).<br />
3.4.1.4.5. Analyse <strong>de</strong>s données <strong>de</strong>s séquences<br />
Les séquences ont été vérifiées grâce aux électrophorégrammes. Les séquences ont été<br />
alignées par le programme CLUSTALW (Thompson, J.D. <strong>et</strong> al., 1994). La qualité <strong>de</strong><br />
l'alignement a été contrôlée en utilisant le programme SEAVIEW (Galtier, N. <strong>et</strong> al., 1996).<br />
Pour la comparaison <strong>de</strong>s séquences avec d'autres <strong>de</strong> référence, nous avons utilisé le<br />
programme SeqApp (D. Gilbert ; http://iubio.bio.indiana.edu/soft/molbio/seqapp/; A<br />
Macintosh Biosequence editor, analyser and n<strong>et</strong>work handyman).<br />
3.4.1.5. Sensibilité <strong>de</strong> l’olivier à la galle du coll<strong>et</strong><br />
Les plantes d’olivier, produites par culture in vitro, ont été r<strong>et</strong>irées <strong>de</strong> <strong>leurs</strong> tubes, blessées au<br />
niveau <strong>de</strong> <strong>leurs</strong> tiges par un scalpel stérile, infectées par la souche C58 (CFBP 1903)<br />
d’Agrobacterium tumefaciens, repiquée sur une boîte <strong>de</strong> Pétri par une anse stérile, puis<br />
remises <strong>de</strong> nouveau dans <strong>leurs</strong> tubes dans les mêmes conditions précé<strong>de</strong>ntes tout en suivant<br />
quotidiennement l’apparition <strong>de</strong>s galles.<br />
3.4.2. Etu<strong>de</strong> bioinformatique<br />
L'élucidation <strong>de</strong> la séquence du génome humain a permis d'i<strong>de</strong>ntifier un certain nombre <strong>de</strong><br />
gènes impliqués dans le cancer. Les gènes que nous étudions ici sont impliqués dans le cancer<br />
du sein <strong>et</strong> le cancer gastrique.<br />
U.P.M.C./U.S. 135<br />
2010