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Annexes<br />
Tableau 3.2 : Liste <strong>de</strong>s protéines végétales homologues aux protéines impliquées dans le<br />
Nom du gène<br />
humain<br />
Fonction du<br />
gène humain<br />
cancer gastrique humain i<strong>de</strong>ntifiées par blastp<br />
N°accession<br />
<strong>de</strong> la protéine<br />
humaine<br />
Longueur <strong>de</strong><br />
la protéine<br />
humaine<br />
KLF6 krueppel-like NP_001291 283 Aa<br />
CASP10 caspase 10 NP_001221 479 Aa<br />
MUTYH DNA glycosylase NP_036354 546 Aa<br />
N°accession<br />
<strong>de</strong> la protéine<br />
homologue<br />
U.P.M.C./U.S. A 10<br />
2010<br />
Espése<br />
Fonction <strong>de</strong> la<br />
protéine<br />
homologue<br />
XP_002529014 Ricin nucleic acid binding protein<br />
E value<br />
8,00<br />
E-11<br />
Pourcentage<br />
d'i<strong>de</strong>ntité<br />
Longueur <strong>de</strong><br />
la protéine<br />
homologue<br />
42% 372 aa<br />
XP_002465852 Sorgo hypoth<strong>et</strong>ical protein 2,00 E -10 31% 557 aa<br />
CAL64380 Pêche putative neutral invertase 0.059 35% 418 aa<br />
XP_002330026 Peuplier predicted protein 0.32 35% 507 aa<br />
XP_002265027 Vigne hypoth<strong>et</strong>ical protein 1 E -83 41% 506 aa<br />
CAN71629 Vigne hypoth<strong>et</strong>ical protein 2 E -82 39% 1031 aa<br />
Tableau 3.3 : Liste <strong>de</strong>s domaines conservés <strong>de</strong>s protéines homologues recherchées par CDD<br />
Nom du gène<br />
humain<br />
Fonction du<br />
gène humain<br />
N°accession<br />
<strong>de</strong> la<br />
protéine<br />
homologue<br />
FLNB filamin BAB62628<br />
MYH1 Myosin<br />
SPTAN1 Spectrin<br />
DBN1 drebrin<br />
VEPH1 PH domain<br />
SBNO1 Monocyte protein<br />
XP_002307<br />
152<br />
XP_002310<br />
148<br />
XP_002280<br />
049<br />
XP_002299<br />
816<br />
XP_002518<br />
826<br />
E value<br />
1,00<br />
E-06<br />
3,00<br />
E-152<br />
2,00<br />
E-09<br />
0.96<br />
0.003<br />
0.0<br />
dans le cancer du sein<br />
Fonction <strong>de</strong><br />
la protéine<br />
homologue<br />
Hypoth<strong>et</strong>ical<br />
protein<br />
Predicted<br />
protein<br />
Predicted<br />
protein<br />
Predicted<br />
protein<br />
Predicted<br />
protein<br />
Hypoth<strong>et</strong>ical<br />
protein<br />
Longueur<br />
protéine<br />
homologue<br />
990<br />
Aa<br />
1173<br />
Aa<br />
163<br />
Aa<br />
1019<br />
Aa<br />
144<br />
Aa<br />
1281<br />
Aa<br />
Position du<br />
domaine<br />
Nom du<br />
domaine<br />
Fonction du<br />
domaine<br />
106..183 Filamin Filamin<br />
372..437 RRM RNA recognition motif<br />
168..847 MYSc_type_VIII Myosin<br />
21..157 TZ00184 calmodulin<br />
23..85 EFh EF-hand<br />
95..157 EFh EF-hand<br />
501..663 DEXDc DEAD-like helicases<br />
625..721 HELICc Helicase<br />
660..797 SrmB RNA helicases<br />
29..120 PH (PH) domain<br />
E value CDD<br />
6,00<br />
E<br />
-11<br />
2,00<br />
E<br />
-12<br />
1.0<br />
e<br />
-180<br />
3,00<br />
E<br />
-23<br />
2,00<br />
E<br />
-10<br />
3,00<br />
E<br />
-10<br />
5,00<br />
E -49<br />
1,00<br />
E<br />
-15<br />
6,00<br />
E<br />
-20<br />
5,00<br />
E -14<br />
274..424 DEXDc DEAD-like helicases 0.005<br />
686..734 PHD PHD-finger<br />
4,00<br />
E -06<br />
830..887 DEXDc DEAD-like helicases 0.007
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