Rôle de l'herpèsvirus humain de type 6 dans le ... - Epublications

injectées à des souris immunodéprimées, alors que des cellules produisant la protéine DR7
tronquée ne le sont pas. Par ailleurs, la séquence de DR7 a été détectée dans des tissus cancéreux,
notamment des ganglions lymphatiques issus de lymphomes hodgkiniens et non-hodgkiniens
(Kashanchi et al., 1997).
Le fragment SalI-L étudié alors par Kashanchi et al. (1997), est issu de la souche U1102
du variant A de l’HHV-6, et l’ORF-1 décrit est prédit comme contenant 357 acides aminés (aa).
Gompels et al., (1995), ont effectué en 1995 le séquençage complet de la souche U1102 et
prédisent le gène DR7 comme correspondant à une protéine de 363 aa.
L’analyse de la séquence du génome de la souche Z29 du variant B a permis de prédire
l’existence d’un ORF nommé alors DR6 et comprenant deux exons nommés DR6EX1 et
DR6EX2. La comparaison de séquence a montré que les exons DR6EX1 et DR6EX2 présentent
respectivement 89,1% et 88,8% d’homologie avec les gènes DR6 et DR7 de la souche U1102 du
variant A (Dominguez et al., 1999). Ceci suggère une divergence certaine inter-variants entre les
ORFs considérés, ou bien la possibilité d’une erreur de prédiction lors du séquençage de la
souche U1102 (figure 22). Schleiman et al (2009) ont montré que le produit du gène DR6 du
variant B est une protéine précoce, à localisation nucléaire, et formant un complexe avec le
facteur de processivité p41 de l’ADN polymérase virale.
La souche HST a été séquencée par l’équipe du professeur Yamanishi (Isegawa et al.,
1999), et la comparaison des séquences des ORFs avec ceux de la souche U1102 montre
notamment une différence au niveau du gène DR7, avec quatre autres gènes (DR2, U86/90,
U89/90 et U95). Contrairement au reste du génome, ces gènes présentent moins de 70%
d’homologie entre les deux variants. De plus, la prédiction d’ORF sur la séquence de la souche
HST, contrairement à la séquence de la souche Z29, permet de déterminer deux gènes distincts au
niveau de DR6 et DR7, correspondant respectivement aux premier et deuxième exons du gène
DR6 prédit sur la séquence de Z29 (DR6EX1 et DR6EX2). La séquence du gène DR6 de HST
présente 84,5% d’homologie avec celle de U1102, alors que la séquence correspondant au gène
DR7 ne présente que 42,2% d’homologie. Cela est du à la présence de deux délétions et une
insertion dans la séquence du gène DR7 de la souche HST, induisant un décalage précoce du
cadre de lecture. Ces mutations ne sont cependant pas détectées au sein de la souche HST
cultivée au sein du laboratoire de microbiologie de la faculté de pharmacie de Limoges. La
124