10.12.2012 Views

Κεφάλαιο 1 - Nemertes

Κεφάλαιο 1 - Nemertes

Κεφάλαιο 1 - Nemertes

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

ΑΝΑΣΚΟΠΗΣΗ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΗΣ ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑΣ<br />

Με ολοκλήρωση της παραπάνω εξίσωσης µπορούµε να εξαγάγουµε τη ταχύτητα και τη<br />

µετατόπιση. Εάν οι ολοκληρώσεις αυτές γίνουν για κάθε άτοµο και σε διάφορα χρονικά<br />

διαστήµατα από µια αρχική κατάσταση, τότε µπορούν να συγκεντρωθούν αναλυτικές<br />

πληροφορίες για την κίνηση κάθε ατόµου [27]. Υπολογίζοντας µέσες τιµές σε χρόνο, χώρο ή<br />

και τα δύο, µπορούν να εξαχθούν µακροσκοπικές φυσικές ιδιότητες. Για µόρια µε<br />

πολύπλοκη γεωµετρία ο νόµος του Newton δεν επαρκεί. Ανάλογα µε το τύπο µοριακού<br />

µοντέλου που χρησιµοποιείται, στην προσοµοίωση υιοθετείται µια γενικευµένη µορφή της<br />

εξίσωσης του Newton. Για παράδειγµα, όταν χρησιµοποιείται ένα µοντέλο στερεού σώµατος,<br />

πρέπει να λαµβάνεται υπόψη η περιστροφή των µορίων γύρω από τη θέση ισορροπίας τους.<br />

Ωστόσο, όσο πολύπλοκη και αν είναι η εξίσωση κίνησης, η βασική διαδικασία<br />

προσοµοίωσης είναι πάντα ίδια: αρχικά ολοκληρώνεται η εξίσωση κίνησης για κάθε µόριο<br />

και υπολογίζονται οι δυναµικές παράµετροι και στη συνέχεια υπολογίζονται οι µέσες τιµές<br />

των δυναµικών παραµέτρων για την εξαγωγή των µακροσκοπικών φυσικών ιδιοτήτων. Ο<br />

υπολογισµός των διαµοριακών δυνάµεων, λόγω της ηλεκτρικής/ηλεκτροµαγνητικής φύσης<br />

των δυνάµεων, απαιτεί την ύπαρξη κατάλληλων µοντέλων διαµοριακού δυναµικού που<br />

περιγράφουν τις διαµοριακές αλληλεπιδράσεις. Τα µοντέλα αυτά συνήθως υπολογίζονται<br />

από πειραµατικά δεδοµένα ή από υπολογισµούς κβαντοµηχανικής. Συνήθως λαµβάνεται<br />

υπόψη η αλληλεπίδραση ανάµεσα σε δύο ή τρία µόρια, καθώς η συνεισφορά περισσότερων<br />

σωµατιδίων είναι αµελητέα και µπορεί να αγνοηθεί εντελώς ή να παρουσιαστεί σαν<br />

διορθωτικός συντελεστής στην εξίσωση δυναµικού [27].<br />

Η Μοριακή ∆υναµική, µε την ραγδαία ανάπτυξη της υπολογιστικής ισχύος των σύγχρονων<br />

υπολογιστών, έχει αναπτυχθεί σηµαντικά τα τελευταία χρόνια. Αποτελεί σηµαντικό εργαλείο<br />

για τη µελέτη της διαδικασίας σχηµατισµού υλικών και των ιδιοτήτων των τελευταίων, ενώ<br />

χρησιµοποιείται ολοένα και περισσότερο για τη µελέτη προβληµάτων µετάδοσης ενέργειας<br />

[28]-[37]. Βασικοί περιορισµοί της µεθόδου αποτελούν η ανάγκη για καθορισµό µιας όσο<br />

το δυνατόν ακριβέστερης σχέσης δυναµικού και το µέγεθος των συστηµάτων που µπορούν<br />

να µελετηθούν. Όσον αφορά τον πρώτο περιορισµό, υπάρχουν δοκιµασµένες εµπειρικές<br />

σχέσεις που περιγράφουν ικανοποιητικά τα περισσότερα από τα υλικά που ενδιαφέρουν (για<br />

το πυρίτιο για παράδειγµα χρησιµοποιείται το δυναµικό Stillinger-Webber [38]).<br />

Όπως προαναφέρθηκε, ο µεγαλύτερος περιορισµός της Μοριακής ∆υναµικής ανάλυσης είναι<br />

το µέγεθος των συστηµάτων που µπορούν να προσοµοιωθούν. Προσοµοιώσεις ρευστών<br />

µπορεί να περιλαµβάνουν έως και 200,000 µόρια, ενώ στερεών από 10 έως 100 εκατοµµύρια<br />

24

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!