Das Magazin - Ausgabe 03 - Systembiologie

Abbildung 1: Visualisierung des Wachstums von Microtubuli mittels TIRF.
Time-Differenz-Bild aus einer Zeitserie mit stabil transfizierten EB-1 YFP MDCK Zellen. Die gewachsene Distanz ist rot eingefärbt (C. Böhlke, Med. Klinik IV,
Universität Freiburg).
und das BIOSS-Exzellenzcluster getragen. Neue Geräte werden
über Förderanträge von Gruppen oder einzelnen Forschern beschafft,
die dann die Geräte an das LIC übertragen.
Erfolgreich durch Vernetzung
Im BIOSS-Exzellenzcluster arbeitet das LIC mit der 11. Technischen
Fakultät an neuen, intelligenten Mikroskop-Systemen
(4D-Analyzer), die Mikrofluidik, Automatisierung und Bildverarbeitung
integrieren. Die erfolgreiche Zusammenarbeit mit der
biologischen und der medizinischen Fakultät spiegelt sich in
zahlreichen, gemeinsamen, hochrangigen Publikationen (Referenzen
1-5) wider. Kollaborationen bestehen mit den Imaging Facilities
des Max-Planck-Instituts in Freiburg und dem Friedrich-
Miescher-Institut in Basel. Das LIC ist Mitglied der Europäischen
Lichtmikroskopie-Initiative (ELMI) und assoziierter Partner in
Euro-BioImaging. Roland Nitschke ist mit Elisa May deutscher
Koordinator für EuroBioImaging und das in 2010 gegründete
deutsche BioImaging Netzwerk (http://bioimagingde.org). Das
LIC unterhält langjährige Partnerschaften mit Firmen wie Carl
Abbildung 2: Konfokaler 3D Stapel eines 7 Tage
alten Hühnchen Embryos
Zeiss MicroImaging (Jena, Göttingen) und ibidi GmbH (München).
Mit der Bundesanstalt für Materialforschung, Fluka und Schott
wurden Tools zur Kalibrierung von Fluoreszenzmikroskopen entwickelt
und patentiert (Resch et al., 2008).
Referenzen:
Boehlke,C., Kotsis,F., Patel,V., Braeg,S., Voelker,H., Bredt,S.,
Beyer,T., Janusch,H., Hamann,C., Godel,M., Muller,K., Herbst,M.,
Hornung,M., Doerken,M., Kottgen,M., Nitschke,R., Igarashi,P.,
Walz,G., and Kuehn,E.W. (2010). Primary cilia regulate mTORC1
activity and cell size through Lkb1. Nat. Cell Biol. 12, 1115-1122.
Emmenlauer,M., Ronneberger,O., Ponti,A., Schwarb,P., Griffa,A.,
Filippi,A., Nitschke,R., Driever,W., and Burkhardt,H. (2009).
XuvTools: Free, fast and reliable stitching of large 3D datasets. J.
Microsc. 233, 42-60.
Lienkamp,S., Ganner,A., Boehlke,C., Schmidt,T., Arnold,S.J.,
Schafer,T., Romaker,D., Schuler,J., Hoff,S., Powelske,C., Eifler,A.,
Kronig,C., Bullerkotte,A., Nitschke,R., Kuehn,E.W., Kim,E.,
Burkhardt,H., Brox,T., Ronneberger,O., Gloy,J., and Walz,G.
(2010). Inversin relays Frizzled-8 signals to promote proximal
pronephros development. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A 107,
20388-20393.
Resch-Genger,U., Grabolle,M., Cavaliere-Jaricot,S., Nitschke,R.,
and Nann,T. (2008). Quantum dots versus organic dyes as fluorescent
labels. Nat. Methods 5, 763-775.
Tay,T.L., Ronneberger,O., Ryu,S., Nitschke,R., and Driever,W.
(2011). Comprehensive catecholaminergic projectome analysis
reveals single-neuron integration of zebrafish ascending and
descending dopaminergic systems. Nat. Com. 2, 171.
Kontakt:
Dr. Roland Nitschke
Life Imaging Center, Zentrum für Biosystemanalyse (ZBSA)
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Roland.Nitschke@biologie.uni-freiburg.de
Immunfluoreszenzfärbung (grün: Nervenzellen, rot: Muskelzellen) Größe des
Datensatzes 32 GB mit 100 Teilbildern mit jeweils160 z-Ebenen (R. Nitschke,
www.imaging.uni-freiburg.de
LIC und S. Theiss, UCL London)
www.systembiologie.de
Forschung Mikroskopie auf höchstem Level
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