Identifizierung und Charakterisierung von potentiellen ...
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Material 27<br />
3.1.4 Plasmide<br />
Zum Einsatz gekommen sind folgende Vektoren:<br />
• pGEM ® -T Easy <strong>von</strong> Promega zum Klonieren <strong>von</strong> PCR-Produkten über T/A-Basen-<br />
Überhänge.<br />
• pQE-30-Vektoren <strong>von</strong> Qiagen <strong>und</strong> deren Derivate, vornehmlich als Expressionsvektor<br />
genutzt.<br />
• pGEX-6P-1 Vektor <strong>von</strong> GE Healthcare, vornehmlich als Expressionsvektor genutzt.<br />
3.1.5 Großgeräte, Laborapparaturen <strong>und</strong> Websoftware<br />
Gerätebezeichnung (Hersteller)<br />
Bakterienzellwachstum, -zentrifugation, -arbeiten<br />
Brutschrank Binder CB 150 (Binder)<br />
Kühlzentrifuge Sigma 3-18 K (Sigma)<br />
Sterilbank Nuaire Nu-425-600 (Nuaire)<br />
Thermoschüttler Nuova 4230 (New Brunswick Scientific)<br />
Ultraschallanlage Branson (Branson)<br />
Protein-Aufreinigung, -Analyse, -Konzentrierung, -Trennung<br />
Affinitätschromatographische <strong>und</strong> größenausschlusschromatographische Säulen (GE Healthcare)<br />
Äkta FPLC (GE Healthcare)<br />
Ettan Dalt six 2D-Elektrophoreseeinheit, 220 V (GE Healthcare)<br />
Fokussierungsanlage Multiphor II Elektrophoresesystem (GE Healthcare)<br />
Hochdruck-Chromatografie-Anlage ProteomLab PF-2D (Beckman Coulter)<br />
Konzentrierungseinheit Amicon ® Ultra-Serie (Millipore)<br />
Massenspektrometer MALDI-TOF Biflex II (Bruker Daltonics)<br />
Ultrazentrifuge Optima TM -Serie (Beckman Coulter)<br />
Molekularbiologische, genetische Arbeiten<br />
PCR-Gerät, Thermocycler T Gradient (Biometra)<br />
RT-PCR-Thermocycler StepOne (Applied Biosystems)<br />
UV-Spektralphotometer Cary 50 UV-Vis (Varian)<br />
Wasser-Reinigungssystem Millipore Simplicity 185 (Millipore)<br />
Vorhersage <strong>von</strong> Protein-Sek<strong>und</strong>ärstrukturen mit Hilfe des Programms SOSUI [Hirokawa et al., 1998]<br />
Protein-Sequenzvergleiche unter Zuhilfenahme <strong>von</strong> NCBI Sequenz-alignment-Programms BLAST<br />
[Altschul et al., 1990]<br />
Grafische Darstellung <strong>von</strong> Sequenz-alignments mittels ESPript [Gouet et al., 1999]
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