Identifizierung und Charakterisierung von potentiellen ...

Diskussion 93
Publikationen zwar über die Abweichung von theoretischen und ermittelten Werten auch
beim Molekulargewicht berichtet [Rodriguez-Pineiro et al., 2005; Wilkins & Williams, 1997].
Aber Einheiten von 3-4 IEP erscheinen zu groß. Es kann nicht abschließend geklärt werden,
womit dieser Unterschied zu begründen ist. Denn die Sequenzabdeckung liegt bei den
Proteinen über oder nahe 30 %. Und auch das Molekulargewicht zeigt sich in allen Fällen mit
dem Trennbild im SDS-Gel übereinstimmend. Interessant ist auch hier, dass es nur bei der
Identifizierung von Proteinen aus der PF-2D und den davon abgeleiteten pH-Werten zu solch
einer Differenz gekommen ist. Möglich sind noch posttranslationale Modifikationen oder ein
Anbinden von Membranbestandteilen an hydrophobe Aminosäurereste, wie z. B. den
vermuteten Membrananker von PilN, die den IEP verändern können.
6.2.2 Analyse der identifizierten Proteine
Von den neun Proteinen, die mittels der Gelelektrophorese identifiziert wurden (s. Tab. V.1),
findet sich nur FliC bei den beiden Mutanten fliA - und flaR - wieder; ansonsten kommt es zu
keiner weiteren Schnittmenge. FliC ist ein 47,8 kDa großer C-terminaler Bestandteil des
Flagellin von Legionella pneumophila Corby. FliA reguliert die Transkriptionskontrolle von
Flagellen-Synthese-Genen bzw. insgesamt den Genen der bakteriellen Motilität [Kazmierczak
et al., 2005], und auch FlaR zeigt zumindest Binde-Affinität zum flaA-Promotor [Heuner et
al., 2000]. Dass FliC dann in den Mutanten weniger stark erscheint als im Wildtyp, bestätigt
also die Regulation der Flagellen-Synthese. Allerdings ist es verwunderlich, dass FlaA, als
Hauptkomponente der Flagelle, nicht als Differenz detektiert wurde. Zieht man die
Publikation von Lebeau et al. [2005] heran, so erscheint der FlaA-Spot dort extrem klein und
kaum sichtbar. Selbst bei hier bei 30 °C gewachsenen Legionellen, wo es im Vergleich zu bei
37 °C gewachsenen vermehrt zur Flagellenbildung kommen sollte [Heuner et al., 1999], tritt
das FlaA Protein so dezent in Erscheinung, dass es kaum zu erkennen und ein möglicher
Unterschied zwischen Wildtyp und Mutanten nicht auszumachen ist.
Das in der flaR - -Mutante als heruntergeregelt gefundene TpR-Protein zeigt eine in
allen Organismen hoch konservierte Superhelikalstruktur, den „tetratricopeptide repeat“. In
Bakterien findet man diese Struktur oft in Aspartyl-Phosphat-Phosphatasen wieder [D'Andrea
& Regan, 2003; Andrade et al., 2001]. Die genaue Funktion des TpR hier im vorliegenden
Fall kann nicht geklärt werden, lediglich eine „Bindefunktion“ wird dem Protein
zugeschrieben, was aber bei der superhelikalen Struktur nicht verwundert.
EtfB ist die β-Untereinheit eines Elektronen-Transferproteins [Chen & Swenson,
1994], welches für den Elektronentransport von Dehydrogenasen verantwortlich ist.