Identifizierung und Charakterisierung von potentiellen ...

Ergebnisse 64
Ein weiteres Problem bei den radioaktiv markierten Proteinen ist, dass Proteine, die bei den
im Nährmedium gewachsenen Bakterien nicht vorkommen bzw. nicht sichtbar sind, auch
nicht zu identifizieren sind, da immer nur die Coomassie Blue-gefärbten Proteinspots zur
Identifizierung herangezogen werden können. Für intrazellulär gewachsene Zellen reicht die
Coomassie Blue-Färbung aber bei weitem nicht aus.
5.1.2 Identifizierte Proteine, die im Vergleich zum Wildtyp herunterreguliert oder
nicht detektierbar erscheinen
In den verglichenen Fällen der Mutanten sind keine Proteinspots beobachtet worden, die im
Vergleich zum Wildtyp heraufreguliert, also voluminöser, größer erscheinen. Ebenso sind
keine Proteine detektiert worden, die lediglich in einer der Mutanten auftreten, aber im
Wildtyp fehlen.
Im Falle der intrazellulär gewachsenen Legionellen konnten nur die Proteine per MALDI-
TOF-Massenspektrometrie identifiziert werden, die sich aus den Coomassie Blue-Gelen
herausschneiden ließen; meist waren das die Proteine, die intrazellulär nicht festzustellen
waren.
Leider konnten trotz mehrfacher Versuche nicht alle Proteine identifiziert werden. Neben den
Proteinen, die wegen ihrer Expressionsunterschiede ausgeschnitten wurden, sind auch noch
einige weitere Proteine, die markant und besonders dick, also stark exprimiert, erschienen,
untersucht worden (nicht gezeigt).
Die genauen Software-Einstellungen zur Proteinidentifikation sind in Kap. 4.5.3 angegeben.
Pfeilenummer im
Gelbild/Name
Molekulargewicht
im Gel/theor.
IEP im
Gel/theor.
Beschreibung/Funktion
Sequenzabdeckung
identifizierte
Peptide
Wildtyp - flaR - (s. Abb. V.3)
1 - FliC 47 kDa/47,8 kDa 4,6/4,7 C-Terminus der
Flagellin-Untereinheit
28,2 % 9
2 - TpR 35 kDa/41 kDa 4,9/5,1
in Bakterien als Aspartyl-
Phosphat-Phosphatase 49,1 % 20
aktiv
3 - EtfB 27 kDa/27,3 kDa 6,7/6,3
β-Untereinheit des
Elektronen-
40,2 % 10
Transferproteins
4 - Com1 27 kDa/28,5 kDa 6,8/7,7 „outer membrane
protein“
41,8 % 9
5 - hypoth. Protein 17 kDa/16,2 kDa 5,0/5,4 54,3 % 6
6 - RplI 18 kDa/16,5 kDa 6,4/6,1 ribosomales Protein L9;
bindet an die 23S-rRNA
41,6 % 6